概括
基因 9056
象征 SLC7A7
同义词 lat3 | lpi | mop-2 | y+lat1 | y+lat-1
描述 Solute Carrier家族7成员7
参考 MIM:603593|HGNC:HGNC:11065|ENSEMBL:ENSG00000155465|HPRD:04667|Vega:Otthumg0000000028692
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q11.2
Pascal P值 0.861
胎儿β -0.353
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.047

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG20828120 14 23292092 SLC7A7 3.5e-8 -0.02 1.03E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CDGAP 0.76 0.81
TGM2 0.76 0.80
PARP14 0.76 0.78
timp3 0.72 0.78
ELF1 0.72 0.75
TGFBR3 0.72 0.78
cobll1 0.71 0.77
卡6 0.71 0.71
ABCB1 0.70 0.74
PAPSS2 0.70 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Med19 -0.46 -0.49
Stra13 -0.45 -0.56
TMSB10 -0.45 -0.50
C18orf21 -0.45 -0.48
C12orf45 -0.44 -0.51
SCNM1 -0.44 -0.49
LSM7 -0.44 -0.48
SNRPD2 -0.44 -0.52
Znf32 -0.43 -0.51
polb -0.43 -0.47

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0015171 氨基酸跨膜转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006461 蛋白质复合物组件 塔斯 9829974
去:0006520 氨基酸代谢过程 塔斯 9829974
去:0006810 运输 IEA -
去:0006810 运输 塔斯 9829974
去:0006865 氨基酸转运 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 9829974
GO:0016323 基底外侧质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组细胞表面相互作用在血管壁 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Basigin相互作用 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸跨质膜的转运 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borlak肝癌EGF UP 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与CBFB MYH11融合 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HBV感染的Wieland 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Radmacher AML预后 78 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhang GATA6靶向DN 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
coates巨噬细胞M1 vs M2向上 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戴维斯多发性骨髓瘤与MGUS DN 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist IL6剥夺 20 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRAS与基质刺激 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤PR DN 44 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因