基因页面:PAPSS2

Summary？
基因 9060
象征 PAPSS2
Synonyms atpsk2 | bcym4 | sk2
Description 3'-磷酸腺苷5'-磷脂合酶2
参考erence MIM:603005|HGNC：HGNC：8604|ENSEMBL：ENSG00000198682|HPRD：04303|Vega：Otthumg0000000018683
基因类型 蛋白质编码
Map location 10q24
pascal p-value 0.284
DEG P值 DEG：SANDERS_2014：DS1_P = 0.163：DS1_BETA = 0.019700：DS2_P = 9.84E-02：DS2_BETA = -0.081：DS2_FDR = 2.93E-01
胎儿β -0.737
DMG 1(# studies)

Gene in Data Sources
基因集名称 Method of gene set Description 信息
CV:GWASdb Genome-wide Association Studies 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Sanders_2013 微阵列 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列（LCLS）上的微阵列进行全基因组基因表达谱。
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
表达 Meta-analysis of gene expression p价值：1.405

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@DNM表

Gene 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
PAPSS2 Chr10 89504941 t C NM_001015880
NM_004670		 。
。		 沉默的
沉默的		 Schizophrenia DNM:Fromer_2014

@差异甲基化基因

probe 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
CG22897130 10 89419623 PAPSS2 7.48e-5 -0.311 0.025 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SFRS1 0.96 0.93
SFRS7 0.96 0.93
SMAD4 0.95 0.94
coro1c 0.95 0.95
PDCL 0.95 0.92
H2AFY 0.94 0.94
RBBP4 0.94 0.94
aldh18a1 0.94 0.94
pOLDIP3 0.94 0.94
SNRNP40 0.94 0.93
前10个负共表达基因
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.75 -0.90
AF347015.31 -0.74 -0.89
AF347015.27 -0.73 -0.88
AF347015.33 -0.73 -0.87
mt-cyb -0.73 -0.88
AF347015.8 -0.73 -0.90
AF347015.15 -0.70 -0.88
FXYD1 -0.70 -0.86
AIFM3 -0.69 -0.77
ifi27 -0.68 -0.83

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 nucleotide binding IEA -
去：0004020 腺苷硫酸盐激酶活性 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去：0005524 ATP结合 IEA -
去：0004781 硫酸盐腺苷转移酶（ATP）活性 ISS -
GO：0016779 nucleotidyltransferase activity ISS -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000103 硫酸盐同化 IEA -
去：0001501 骨骼系统开发 tAS 9771708

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG PURINE METABOLISM 159 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG Selenoamino酸代谢 26 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg硫代谢 13 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME BIOLOGICAL OXIDATIONS 139 91 All SZGR 2.0 genes in this pathway
小分子的反应组胞质硫化 14 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome II期结合 70 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA UP 294 178 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BASAKI YBX1 TARGETS DN 384 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rodrigues NTN1靶向DN 158 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang LMO4靶向DN 352 225 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jaeger转移 44 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 157 104 All SZGR 2.0 genes in this pathway
帕帕斯帕斯帕贝多诺斯不稳定的动脉粥样硬化斑块 52 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌变性DN 537 339 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化Kras DN 142 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN 153 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌根源与基础 330 217 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BENPORATH NANOG TARGETS 988 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SANSOM APC TARGETS DN 366 238 All SZGR 2.0 genes in this pathway
棕色髓样细胞发育DN 129 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REN ALVEOLAR RHABDOMYOSARCOMA DN 408 274 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ramalho茎DN 74 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BROWNE HCMV INFECTION 14HR DN 298 200 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindvall通过Tert Up永生 78 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2向上 428 266 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 4 307 185 All SZGR 2.0 genes in this pathway
哈里斯脑癌祖细胞 44 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein Esrra靶向对雌激素DN的反应 41 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林黑色素瘤副本编号DN 41 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cheng由雌二醇印记 110 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID BREAST CANCER ERBB2 UP 147 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Buckanovich T淋巴细胞在肿瘤DN上 24 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Takeer吉西他滨抗性DN 122 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ichiba移植与宿主疾病D7 DN 40 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌Kras DN 435 289 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Han Satb1靶向DN 442 275 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Valk AML群集9 35 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein ESR1目标 85 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO HEPATOBLASTOMA DN 267 160 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lu eszh2靶向DN 414 237 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GUILLAUMOND KLF10 TARGETS DN 30 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 1597年 1604 1A，M8 海关a-miR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC