基因页:PAPSS1
概括?
基因 | 9061 |
象征 | PAPSS1 |
同义词 | atpsk1 | papss | sk1 |
描述 | 3'-磷酸腺苷5'-磷脂合酶1 |
参考 | MIM:603262|HGNC:HGNC:8603|ENSEMBL:ENSG00000138801|HPRD:09132|Vega:Otthumg00000131210 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q24 |
Pascal P值 | 0.125 |
Sherlock P值 | 0.529 |
胎儿β | -0.335 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08541219 | 4 | 108641287 | PAPSS1 | -0.03 | 0.32 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2850413 | CHR4 | 107959343 | PAPSS1 | 9061 | 0.13 | 顺式 | ||
RS434649 | CHR4 | 107971975 | PAPSS1 | 9061 | 0.12 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PAPSS1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
synj1 | 0.94 | 0.90 |
FAM73A | 0.94 | 0.89 |
NCOA7 | 0.93 | 0.85 |
HLF | 0.93 | 0.85 |
EFR3A | 0.93 | 0.89 |
GLS | 0.93 | 0.85 |
MBNL1 | 0.93 | 0.86 |
UHMK1 | 0.93 | 0.88 |
arfgef2 | 0.93 | 0.82 |
Chic1 | 0.93 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.50 | -0.58 |
FADS2 | -0.46 | -0.32 |
AC006276.2 | -0.46 | -0.41 |
NME4 | -0.45 | -0.56 |
C9orf46 | -0.45 | -0.46 |
RPL23A | -0.44 | -0.47 |
TBC1D10A | -0.44 | -0.31 |
traf4 | -0.43 | -0.45 |
Dynlt1 | -0.43 | -0.52 |
RPL36 | -0.43 | -0.48 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Purine代谢 | 159 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG Selenoamino酸代谢 | 26 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg硫代谢 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组胞质硫化 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome II期结合 | 70 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多恩乳腺癌类DN | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola sezary综合征 | 98 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |