概括
基因 9061
象征 PAPSS1
同义词 atpsk1 | papss | sk1
描述 3'-磷酸腺苷5'-磷脂合酶1
参考 MIM:603262|HGNC:HGNC:8603|ENSEMBL:ENSG00000138801|HPRD:09132|Vega:Otthumg00000131210
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q24
Pascal P值 0.125
Sherlock P值 0.529
胎儿β -0.335
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08541219 4 108641287 PAPSS1 -0.03 0.32 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2850413 CHR4 107959343 PAPSS1 9061 0.13 顺式
RS434649 CHR4 107971975 PAPSS1 9061 0.12 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
synj1 0.94 0.90
FAM73A 0.94 0.89
NCOA7 0.93 0.85
HLF 0.93 0.85
EFR3A 0.93 0.89
GLS 0.93 0.85
MBNL1 0.93 0.86
UHMK1 0.93 0.88
arfgef2 0.93 0.82
Chic1 0.93 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.50 -0.58
FADS2 -0.46 -0.32
AC006276.2 -0.46 -0.41
NME4 -0.45 -0.56
C9orf46 -0.45 -0.46
RPL23A -0.44 -0.47
TBC1D10A -0.44 -0.31
traf4 -0.43 -0.45
Dynlt1 -0.43 -0.52
RPL36 -0.43 -0.48

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Purine代谢 159 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG Selenoamino酸代谢 26 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg硫代谢 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生物氧化 139 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组胞质硫化 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome II期结合 70 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多恩乳腺癌类DN 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola sezary综合征 98 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭葡萄糖剥夺DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因