基因页:ZNF697
Summary?
GeneID | 90874 |
象征 | ZNF697 |
同义词 | - |
描述 | 锌指蛋白697 |
参考 | HGNC:HGNC:32034|Ensembl:ENSG00000143067|Vega:Otthumg0000000012962 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p12 |
Pascal P值 | 0.795 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 额叶皮质BA9 |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0235 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00814 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08978953 | 1 | 120190520 | ZNF697 | 5.93e-10 | 0.007 | 9.07e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNF697_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | All SZGR 2.0 genes in this pathway |
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 | 79 | 50 | All SZGR 2.0 genes in this pathway |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | All SZGR 2.0 genes in this pathway |
Sabates结直肠腺瘤的大小 | 23 | 12 | All SZGR 2.0 genes in this pathway |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | All SZGR 2.0 genes in this pathway |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | All SZGR 2.0 genes in this pathway |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | All SZGR 2.0 genes in this pathway |
ERBB2同工3的PEDERSEN转移3 | 20 | 9 | All SZGR 2.0 genes in this pathway |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | All SZGR 2.0 genes in this pathway |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 2234 | 2240 | M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-125/351 | 2636 | 2642 | 1a | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
HSA-MIR-125A脑 | UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG | ||||
mir-15/16/195/424/497 | 565 | 571 | 1a | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 1268 | 1274 | M8 | HSA-MIR-17-5P | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
mir-181 | 1232 | 1238 | M8 | HSA-MIR-181A脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-182 | 1212 | 1219 | 1A,M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca | ||||
mir-218 | 1221 | 1227 | 1a | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
mir-219 | 3035 | 3041 | M8 | HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu |
mir-23 | 2607 | 2613 | M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-24 | 2960 | 2966 | 1a | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
mir-26 | 1877年 | 1883年 | M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
HSA-MIR-26BSZ | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
mir-323 | 2607 | 2613 | 1a | HSA-MIR-323脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
mir-381 | 1977年 | 1984 | 1A,M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
mir-503 | 565 | 571 | 1a | HSA-MIR-503 | uagcagcgggaacaguucugcag |
mir-539 | 1318 | 1324 | 1a | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |
mir-543 | 1233 | 1239 | M8 | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 1267 | 1273 | M8 | HSA-MIR-93脑 | aaagugcuguucgugcagguag |
HSA-MIR-302A | uaagugcuugcauguuuguga | ||||
HSA-MIR-302B | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
HSA-MIR-302C | uaagugcuuccauguucagugg | ||||
HSA-MIR-302D | Uaagugcuauguugugugu | ||||
HSA-MIR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
HSA-MIR-373 | Gaagugcuucgauuuggggugu | ||||
HSA-MIR-520E | Aaagugcuuuuuugaggg | ||||
HSA-MIR-520A | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
HSA-MIR-520B | aaagugcuuuuuuagaggg | ||||
HSA-MIR-520C | aaagugcuuuuuuaggggug | ||||
HSA-MIR-520D | aaaguguuugugggguggguu | ||||
miR-96 | 1258 | 1264 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |
HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |