Summary
GeneID 90874
象征 ZNF697
同义词 -
描述 锌指蛋白697
参考 HGNC:HGNC:32034|Ensembl:ENSG00000143067|Vega:Otthumg0000000012962
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p12
Pascal P值 0.795
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
额叶皮质BA9

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08978953 1 120190520 ZNF697 5.93e-10 0.007 9.07e-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006350 转录 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 79 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC3靶向 501 327 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sabates结直肠腺瘤的大小 23 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ERBB2同工3的PEDERSEN转移3 20 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 2234 2240 M8 HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-125/351 2636 2642 1a HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG
mir-15/16/195/424/497 565 571 1a HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 1268 1274 M8 HSA-MIR-17-5P CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-181 1232 1238 M8 HSA-MIR-181A AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-182 1212 1219 1A,M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-218 1221 1227 1a HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-219 3035 3041 M8 HSA-MIR-219 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-23 2607 2613 M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-24 2960 2966 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-26 1877年 1883年 M8 HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir-323 2607 2613 1a HSA-MIR-323 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
mir-381 1977年 1984 1A,M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-503 565 571 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag
mir-539 1318 1324 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-543 1233 1239 M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 1267 1273 M8 HSA-MIR-93 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu
miR-96 1258 1264 1a HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc
HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc