概括
基因 9099
象征 USP2
同义词 UBP41 | USP9
描述 泛素特异性肽酶2
参考 MIM:604725|HGNC:HGNC:12618|Ensembl:ENSG0000000036672|HPRD:05287|Vega:Otthumg00000166200
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q23.3
Pascal P值 0.649
胎儿β -3.21
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16930362 Chr10 74890320 USP2 9099 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 16189514
去:0004197 半胱氨酸型内肽酶活性 塔斯 9827704
去:0004221 泛素硫酯酶活性 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005886 质膜 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM6 46 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Delta FOSB目标8WK 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kaab失败的心房DN 141 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuninger IGF1与PDGFB的目标 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 118 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔逊蛋白酶在肿瘤骨接口上 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇5的时间反应5 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-15/16/195/424/497 481 487 1a HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-24 460 466 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-331 491 498 1A,M8 HSA-MIR-331 gccccugggccuauccuagaa
mir-503 480 487 1A,M8 HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag
mir-504 153 159 M8 HSA-MIR-504 agacccugucugcacucuau