基因页:CREB3L1
概括?
基因 | 90993 |
象征 | CREB3L1 |
同义词 | 绿洲 |
描述 | cAMP响应元件结合蛋白3样蛋白1 |
参考 | MIM:616215|HGNC:HGNC:18856|ENSEMBL:ENSG00000157613|HPRD:16751|Vega:Otthumg00000166423 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P11.2 |
Pascal P值 | 1.334E-7 |
胎儿β | -0.144 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 3 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21690489 | 11 | 46330260 | CREB3L1 | 5.51E-4 | -0.323 | 0.049 | DMG:Wockner_2014 |
CG03131732 | 11 | 46317475 | CREB3L1 | 7.15e-9 | -0.011 | 3.59E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
CG01532396 | 11 | 46265134 | CREB3L1 | 2.13e-8 | -0.012 | 7.23e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CREB3L1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg黑色素发生 | 102 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG加压素调节的水重吸收 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG前列腺癌 | 89 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌 | 96 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOOI ST7靶向DN | 123 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向8小时 | 164 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向12小时 | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Barretts食道和食道癌 | 26 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子有Sox4结合位点 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 | 83 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamazaki TCEB3靶向 | 175 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HU基因毒素作用直接与间接24小时 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克拉斯的iwanaga致癌作用 | 170 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers | 80 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |