基因页：MTMR6
概括？
| 基因 | 9107 |
| 象征 | MTMR6 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 肌管蛋白相关蛋白6 |
| 参考 | MIM：603561|HGNC：HGNC：7453|Ensembl：ENSG00000139505|HPRD：11946|Vega：Otthumg0000000016606 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13Q12 |
| Pascal P值 | 0.504 |
| Sherlock P值 | 0.892 |
| 胎儿β | -0.123 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24867566 | 13 | 25861182 | MTMR6 | 6.43e-8 | -0.011 | 1.59E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4491879 | CHR3 | 189373908 | MTMR6 | 9107 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC087645.2 | 0.93 | 0.54 |
| CDCA3 | 0.92 | 0.54 |
| Birc5 | 0.92 | 0.53 |
| ube2c | 0.92 | 0.48 |
| 奥克布 | 0.92 | 0.46 |
| FAM64A | 0.91 | 0.53 |
| CDC45L | 0.91 | 0.47 |
| TACC3 | 0.91 | 0.59 |
| Zwint | 0.91 | 0.68 |
| CCNB2 | 0.91 | 0.50 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.27 | -0.36 | -0.46 |
| AF347015.33 | -0.35 | -0.44 |
| AF347015.15 | -0.35 | -0.48 |
| MT-CO2 | -0.35 | -0.43 |
| mt-cyb | -0.35 | -0.45 |
| AF347015.8 | -0.35 | -0.46 |
| tinagl1 | -0.34 | -0.38 |
| AF347015.26 | -0.34 | -0.48 |
| AF347015.31 | -0.34 | -0.39 |
| AF347015.2 | -0.33 | -0.44 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004725 | 蛋白酪氨酸磷酸酶活性 | nas | 9736772 | |
| 去：0004722 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性 | nas | 9736772 | |
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006470 | 蛋白氨基酸去磷酸化 | nas | 9736772 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005575 | cellular_component | nd | 9736772 | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005635 | 核信封 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11256614 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg果糖和甘露糖代谢 | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg核黄素代谢 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 质膜上的PIP的反应组合成 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Pi代谢 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Puiffe入侵被腹水DN抑制 | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 按拷贝数量的丁肺癌表达 | 100 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 | 182 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林黑色素瘤副本编号DN | 41 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindstedt树突状细胞成熟D | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124.1 | 484 | 490 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-183 | 458 | 464 | M8 | HSA-MIR-183 | uauggcacugguagaauucacug |
| mir-496 | 1909年 | 1916年 | 1A，M8 | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |