概括
基因 9108
象征 MTMR7
同义词 -
描述 肌管蛋白相关蛋白7
参考 MIM:603562|HGNC:HGNC:7454|Ensembl:ENSG00000003987|HPRD:16027|Vega:Otthumg00000163771
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p22
Pascal P值 0.002
Sherlock P值 0.174
主持人 皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03086
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.00057

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16916054 Chr11 91158732 MTMR7 9108 0.11 反式
RS17650385 CHR13 87104244 MTMR7 9108 0.12 反式
RS1480958 CHR15 100575654 MTMR7 9108 0.01 反式
RS2727185 CHR15 100576786 MTMR7 9108 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0004725 蛋白酪氨酸磷酸酶活性 塔斯 9736772
去:0004437 肌醇或磷脂酰肌醇磷酸酶活性 IEA -
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006470 蛋白氨基酸去磷酸化 塔斯 9736772
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 IEA -
去:0005624 膜分数 IEA -
去:0005634 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg果糖和甘露糖代谢 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg核黄素代谢 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在晚期内体膜上PIPS的反应组合成 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pi代谢 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P6 91 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tavazoie转移 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时 55 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-181 1208 1214 1a HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu