基因页:MTMR7
概括?
基因 | 9108 |
象征 | MTMR7 |
同义词 | - |
描述 | 肌管蛋白相关蛋白7 |
参考 | MIM:603562|HGNC:HGNC:7454|Ensembl:ENSG00000003987|HPRD:16027|Vega:Otthumg00000163771 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p22 |
Pascal P值 | 0.002 |
Sherlock P值 | 0.174 |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.03086 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.00057 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16916054 | Chr11 | 91158732 | MTMR7 | 9108 | 0.11 | 反式 | ||
RS17650385 | CHR13 | 87104244 | MTMR7 | 9108 | 0.12 | 反式 | ||
RS1480958 | CHR15 | 100575654 | MTMR7 | 9108 | 0.01 | 反式 | ||
RS2727185 | CHR15 | 100576786 | MTMR7 | 9108 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MTMR7_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0004725 | 蛋白酪氨酸磷酸酶活性 | 塔斯 | 9736772 | |
去:0004437 | 肌醇或磷脂酰肌醇磷酸酶活性 | IEA | - | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006470 | 蛋白氨基酸去磷酸化 | 塔斯 | 9736772 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg果糖和甘露糖代谢 | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg核黄素代谢 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在晚期内体膜上PIPS的反应组合成 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Pi代谢 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P6 | 91 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tavazoie转移 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时 | 55 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-181 | 1208 | 1214 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu |