基因页：在一个

Summary？
基因ID 9118
象征 在一个
同义词 Nef5 | NF-66 | TXBP-1
描述 奈瑟素神经元中间丝蛋白α
参考 MIM：605338|HGNC：HGNC：6057|Ensembl:ENSG00000148798|HPRD：05628|Vega:OTTHUMG00000018986
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q24.33
Pascal P值 2.377E-4
Sherlock P值 0.983
胎儿β 0.284
支持 结构可塑性
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMANNRC
COMPOSITESET
潜在的突触基因

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
LK：是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
克鲁 0.75 0.77
SPARCL1 0.73 0.82
CSRP1 0.73 0.78
SLC25A45 0.72 0.71
电缆1 0.72 0.72
TMBIM1 0.72 0.77
aldoc 0.71 0.76
sftpc 0.71 0.78
TNFSF12 0.71 0.77
C13orf16 0.71 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
nkiras2 -0.62 -0.68
RARS2 -0.60 -0.71
CRMP1 -0.59 -0.65
HN1 -0.59 -0.69
HNRNPAB -0.58 -0.69
PCDHB18 -0.58 -0.66
KIAA1949 -0.58 -0.65
STMN2 -0.58 -0.68
mpp3 -0.58 -0.64
YBX1 -0.58 -0.71

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005200 细胞骨架的结构成分 塔斯 7769995
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007399 神经系统的发展 IEA 神经突（GO期限：5） -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
GO：0060052 神经丝细胞骨架组织 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005883 神经丝 塔斯 神经元，Axon（GO术语级别：11） 7769995

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
vecchi胃癌早期DN 367 220 所有SZGR 2.0基因通路
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 所有SZGR 2.0基因通路
Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散dn 12 6 所有SZGR 2.0基因通路
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 所有SZGR 2.0基因通路
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 所有SZGR 2.0基因通路
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 所有SZGR 2.0基因通路
Benporath Suz12目标 1038 678 所有SZGR 2.0基因通路
Benporath EED目标 1062 725 所有SZGR 2.0基因通路
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 所有SZGR 2.0基因通路
Benporath PRC2目标 652 441 所有SZGR 2.0基因通路
Kannan TP53靶向DN 21 15 所有SZGR 2.0基因通路
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 所有SZGR 2.0基因通路
EWSR1 FLI1融合DN的Rorie目标 30 23 所有SZGR 2.0基因通路
Browne HCMV感染16小时 225 139 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 所有SZGR 2.0基因通路
McClung Delta FOSB目标2WK 48 36 所有SZGR 2.0基因通路
McClung Creb1靶向 100 72 所有SZGR 2.0基因通路
Bacolod抗烷基化剂DN 60 45 所有SZGR 2.0基因通路
道格拉斯BMI1靶向 566 371 所有SZGR 2.0基因通路
Lein本地化到近端树突 37 26 所有SZGR 2.0基因通路
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 所有SZGR 2.0基因通路
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 所有SZGR 2.0基因通路
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 所有SZGR 2.0基因通路
Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 所有SZGR 2.0基因通路
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 所有SZGR 2.0基因通路
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 所有SZGR 2.0基因通路
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 所有SZGR 2.0基因通路
Maekawa ATF2目标 24 19 所有SZGR 2.0基因通路
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 所有SZGR 2.0基因通路

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-203.1 686 692 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-221/222 837 843 M8 hsa-miR-221脑 agcuacauugucugugggggguc
hsa-miR-222脑 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-29 294 300 1a HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-320 225 231 M8 HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-324-3p 723 730 1A，M8 hsa - mir - 324-3p ccacugccccaggugcugcugg
miR-96 1403 1409 M8 HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc