概括
基因 9128
象征 PRPF4
同义词 hprp4 | hprp4p | prp4 | prp4p | rp70 | snrnp60
描述 前MRNA处理因子4
参考 MIM:607795|HGNC:HGNC:17349|ENSEMBL:ENSG00000136875|HPRD:08479|Vega:Otthumg00000020517
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9q31-Q33
Pascal P值 0.169
Sherlock P值 0.04
主持人 皮质
下丘脑
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0357

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RIOK2 0.92 0.86
TAF7 0.91 0.87
Cebpz 0.91 0.88
SMNDC1 0.91 0.87
METAP2 0.91 0.89
N4BP2L2 0.91 0.90
SKIV2L2 0.90 0.85
ppp1cc 0.90 0.84
QRSL1 0.90 0.85
C12orf11 0.89 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.64 -0.72
AF347015.31 -0.63 -0.73
AF347015.27 -0.63 -0.72
mt-cyb -0.63 -0.72
AF347015.8 -0.62 -0.73
AF347015.15 -0.62 -0.73
AF347015.33 -0.62 -0.71
AF347015.2 -0.60 -0.71
ifi27 -0.59 -0.72
pth1r -0.58 -0.69

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0031202 RNA剪接因子活性,延迟机制 nas 9328476
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000398 核mRNA剪接,通过剪接体 经验 12226669
去:0008380 RNA剪接 nas -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 塔斯 9328476
去:0005681 剪接体 nas 9328476
GO:0016607 核斑点 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg剪接体 128 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 140 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA处理 161 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA剪接 111 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOH在CHR9Q中与LOH的Lindgren膀胱癌 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT网络 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA中心网络 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML生存 129 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bacolod抗烷基化剂DN 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因