基因页：PRPF3
概括？
| 基因 | 9129 |
| 象征 | PRPF3 |
| 同义词 | hprp3 | hprp3p | prp3 | prp3p | rp18 | snrnp90 |
| 描述 | 前MRNA处理因子3 |
| 参考 | MIM：607301|HGNC：HGNC：17348|Ensembl：ENSG00000117360|HPRD：07389|Vega：Otthumg0000000012807 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q21.1 |
| 胎儿beta | 1.117 |
| 耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | PRPF3 | 9129 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共同表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| VWA5B2 | 0.78 | 0.75 |
| Arhgef4 | 0.77 | 0.74 |
| PDE4C | 0.77 | 0.75 |
| Shank3 | 0.75 | 0.80 |
| DGKZ | 0.75 | 0.72 |
| kcnip3 | 0.75 | 0.73 |
| SAPS1 | 0.75 | 0.72 |
| pacsin1 | 0.74 | 0.74 |
| SYT15 | 0.74 | 0.77 |
| fmnl1 | 0.74 | 0.68 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RPS6 | -0.52 | -0.63 |
| RPL24 | -0.51 | -0.64 |
| C9orf46 | -0.51 | -0.58 |
| RPS13P2 | -0.50 | -0.59 |
| RPS18 | -0.50 | -0.60 |
| RPS3AP47 | -0.50 | -0.56 |
| RPL27 | -0.50 | -0.61 |
| RPL5 | -0.50 | -0.54 |
| AC079354.7 | -0.50 | -0.52 |
| RPS23 | -0.50 | -0.59 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16189514|17353931 | |
| 去：0031202 | RNA剪接因子活性，移度机制 | tas | 9328476 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000398 | 核mRNA剪接，通过剪接体 | nas | 9328476 | |
| 去：0008380 | RNA剪接 | tas | 9328476 | |
| 去：0007601 | 视觉感知 | IEA | - | |
| 去：0050896 | 对刺激的反应 | IEA | - | |
| 细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | tas | 9328476 | |
| 去：0005681 | 剪接体 | nas | 9328476 | |
| GO：0016607 | 核斑点 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg剪接体 | 128 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basaki YBX1靶向 | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK紫外线反应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4 Fusion靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chiba对TSA的反应 | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时 | 156 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西部肾上腺皮质癌与腺瘤 | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |