基因页:KCNQ4
概括?
基因 | 9132 |
象征 | KCNQ4 |
同义词 | dfna2 | dfna2a | kv7.4 |
描述 | 钾电源门控通道亚家族Q成员4 |
参考 | MIM:603537|HGNC:HGNC:6298|Ensembl:ENSG00000117013|HPRD:04641|Vega:Otthumg00000007730 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 134 |
Pascal P值 | 0.013 |
胎儿β | -0.342 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | KCNQ4 | 9132 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KCNQ4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SMTN | 0.77 | 0.80 |
Lepre1 | 0.76 | 0.72 |
lrdd | 0.75 | 0.74 |
HDAC7 | 0.74 | 0.77 |
FBXL6 | 0.74 | 0.72 |
C7orf27 | 0.73 | 0.73 |
AC004410.1 | 0.73 | 0.75 |
ARHGAP17 | 0.73 | 0.70 |
UCKL1 | 0.73 | 0.68 |
LRCH4 | 0.73 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.48 | -0.50 |
Rapgef4 | -0.45 | -0.47 |
PLA2G4A | -0.45 | -0.49 |
chn1 | -0.44 | -0.46 |
ITM2B | -0.44 | -0.47 |
AF347015.31 | -0.43 | -0.47 |
TPMT | -0.43 | -0.43 |
ACOT13 | -0.43 | -0.48 |
serpini1 | -0.43 | -0.43 |
卡16 | -0.42 | -0.51 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome电压门控钾通道 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组C的UVC响应 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang击倒第二个EGF脉冲 | 293 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |