概括
基因 9132
象征 KCNQ4
同义词 dfna2 | dfna2a | kv7.4
描述 钾电源门控通道亚家族Q成员4
参考 MIM:603537|HGNC:HGNC:6298|Ensembl:ENSG00000117013|HPRD:04641|Vega:Otthumg00000007730
基因类型 蛋白质编码
地图位置 134
Pascal P值 0.013
胎儿β -0.342
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 KCNQ4 9132 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SMTN 0.77 0.80
Lepre1 0.76 0.72
lrdd 0.75 0.74
HDAC7 0.74 0.77
FBXL6 0.74 0.72
C7orf27 0.73 0.73
AC004410.1 0.73 0.75
ARHGAP17 0.73 0.70
UCKL1 0.73 0.68
LRCH4 0.73 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.48 -0.50
Rapgef4 -0.45 -0.47
PLA2G4A -0.45 -0.49
chn1 -0.44 -0.46
ITM2B -0.44 -0.47
AF347015.31 -0.43 -0.47
TPMT -0.43 -0.43
ACOT13 -0.43 -0.48
serpini1 -0.43 -0.43
卡16 -0.42 -0.51

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome电压门控钾通道 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钾通道 98 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jazag tgfb1发出信号 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组C的UVC响应 92 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang击倒第二个EGF脉冲 293 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因