概括?
基因ID 9133
Symbol CCNB2
同义词 HsT17299
描述 cyclin B2
参考 MIM:602755|HGNC:HGNC:1580|Ensembl:ENSG00000157456|HPRD:04131|Vega:OTTHUMG00000132715
基因type protein-coding
地图位置 15q22.2
Pascal P值 1.076E-4
Fetal beta 3.836
eGene Meta

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
CV:GWASDB 全基因组关联研究 gwasdbrecords for schizophrenia
简历:PGCNP Genome-wide Association Study GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
CARD8 0.81 0.78
SS18 0.81 0.75
tob2 0.79 0.74
ZFAND3 0.77 0.74
DHTKD1 0.77 0.75
TMCO3 0.77 0.75
TCF12 0.77 0.71
FUBP3 0.77 0.73
C1orf144 0.77 0.71
TULP3 0.77 0.71
Top 10 negatively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
SYCP3 -0.49 -0.40
AL050337.1 -0.48 -0.36
C5orf53 -0.48 -0.47
AF347015.21 -0.48 -0.49
AC104794.1 -0.48 -0.48
MYL3 -0.45 -0.42
LY96 -0.44 -0.40
CA4 -0.44 -0.44
C1orf54 -0.43 -0.37
DDTL -0.43 -0.36

V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG CELL CYCLE 128 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG OOCYTE MEIOSIS 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG P53 SIGNALING PATHWAY 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PROGESTERONE MEDIATED OOCYTE MATURATION 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FOXM1途径 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID DELTA NP63 PATHWAY 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE MITOTIC 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE CHECKPOINTS 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CYCLIN A B1 ASSOCIATED EVENTS DURING G2 M TRANSITION 15 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC G2 G2 M PHASES 81 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G2 M检查点 45 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA CANCER MICROENVIRONMENT DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SOTIRIOU BREAST CANCER GRADE 1 VS 3 UP 151 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 UP 146 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZERBINI RESPONSE TO SULINDAC DN 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC LEUKEMIA UP 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAL LEUKEMIC STEM CELL DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASAKI YBX1 TARGETS UP 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与正常静止 87 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM CML DIVIDING VS NORMAL QUIESCENT UP 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM NORMAL QUIESCENT VS NORMAL DIVIDING DN 87 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIDUS METASTASIS UP 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR DN 75 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 ACUTE LOF DN 228 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TANG SENESCENCE TP53 TARGETS DN 57 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER CLUSTER 2 33 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSTY CERVICAL CANCER PROLIFERATION CLUSTER 140 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEINHOLD OVARIAN CANCER LOW GRADE DN 20 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Furukawa Dusp6靶向PCI35 DN 74 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH CYCLING GENES 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH PROLIFERATION 147 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JEON SMAD6 TARGETS DN 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIN B CELL LYMPHOMA CLUSTER 8 36 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori前BI淋巴细胞向上 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI LARGE PRE BII LYMPHOCYTE UP 86 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI IMMATURE B LYMPHOCYTE DN 90 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI MATURE B LYMPHOCYTE DN 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移DN 121 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标 108 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OKUMURA INFLAMMATORY RESPONSE LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEART HDAC增殖集群DN 76 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAKI ADULT T CELL LEUKEMIA 176 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yu Myc的目标 42 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤PR 45 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AFFAR YY1 TARGETS DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALAY AML BY NPM1 LOCALIZATION DN 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kamminga EZH2目标 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GREENBAUM E2A TARGETS UP 33 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SU TESTIS 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5 TARGETS UP 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 3 101 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马产前 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD RESPONSE TO UV NHEK DN 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD UV RESPONSE CLUSTER G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Simbulan Parp1靶向DN 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P6 91 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY E2F4 UNSTIMULATED 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LSD1目标DN 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson Gamma辐射响应 40 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY UP 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITEFORD PEDIATRIC CANCER MARKERS 116 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE WNT3A TARGETS UP 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAY TUMORIGENESIS BY ERBB2 CDC25A UP 104 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB DN 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER PLURINET 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG CYCLING GENES 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANTVEER BREAST CANCER ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE EARLY T LYMPHOCYTE UP 107 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST IL6 DEPRIVATION DN 98 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST NRAS SIGNALING DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST NRAS VS STROMAL STIMULATION DN 99 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ISHIDA E2F TARGETS 53 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POOLA INVASIVE BREAST CANCER UP 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G123 UP 45 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS PROLIFERATION UP 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS UNANNOTATED DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蒙特罗甲状腺癌的生存率不佳 12 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER NPC HCP WITH H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINNEPENNINCKX MELANOMA METASTASIS UP 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP 87 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE LITERATURE 44 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE G2 M 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
国外RB1增长目标 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR UP 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION UP 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA LIVER HNF1A TARGETS UP 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BCL3 TARGETS UP 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE NEURONAL DIFFERENTIATION DN 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU CELL CYCLE GENES IN IR RESPONSE 24HR 128 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因