基因页:Rabep1
概括?
基因 | 9135 |
象征 | Rabep1 |
同义词 | Rab5ep | Rabpt5 |
描述 | Rabaptin,Rab GTPase结合效应蛋白1 |
参考 | MIM:603616|HGNC:HGNC:17677|ENSEMBL:ENSG00000029725|HPRD:04684|Vega:Otthumg00000177870 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p13.2 |
Pascal P值 | 0.022 |
Sherlock P值 | 0.815 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | 细胞内贩运 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9912506 | CHR17 | 5199037 | Rabep1 | 9135 | 0.19 | 顺式 | ||
RS3026109 | CHR17 | 5284479 | Rabep1 | 9135 | 0.02 | 顺式 | ||
RS1065483 | CHR17 | 5284769 | Rabep1 | 9135 | 0 | 顺式 | ||
RS1065483 | CHR17 | 5284769 | Rabep1 | 9135 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RABEP1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NCAPG | 0.82 | 0.39 |
VRK1 | 0.78 | 0.45 |
C14orf23 | 0.75 | 0.35 |
ASF1A | 0.72 | 0.56 |
tifa | 0.72 | 0.36 |
PDE1A | 0.71 | 0.37 |
RNF138 | 0.71 | 0.44 |
DDX59 | 0.70 | 0.50 |
HCRTR2 | 0.70 | 0.34 |
SNX6 | 0.69 | 0.51 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC9A3R2 | -0.33 | -0.31 |
tenc1 | -0.32 | -0.45 |
LGI4 | -0.31 | -0.28 |
ZBTB47 | -0.31 | -0.29 |
Bin1 | -0.29 | -0.22 |
CCDC88B | -0.29 | -0.33 |
AC018755.7 | -0.28 | -0.33 |
Suox | -0.28 | -0.06 |
PK4P | -0.28 | -0.28 |
AC013356.5 | -0.28 | -0.21 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AP1G1 | adtg |clapg1 |MGC18255 | 与Adaptor相关的蛋白质复合物1,伽马1亚基 | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12042876|12505986 |
AP1G2 | G2AD | 与Adaptor相关的蛋白质复合物1,伽马2亚基 | - | HPRD | 12505986 |
EEA1 | MST105 |MSTP105 |ZFYVE2 | 早期内体抗原1 | 共同分级 | Biogrid | 10458612 |
GAP43 | B-50 |PP46 | 生长蛋白43 | - | HPRD,Biogrid | 9742146 |
GGA1 | - | Golgi相关,含有ARF结合蛋白1的γadaptin耳朵1 | - | HPRD,Biogrid | 12505986 |
GGA2 | FLJ20966 |KIAA1080 |vear | Golgi相关,含有ARF结合蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 10747088|11387476 |12505986 |
GGA3 | KIAA0154 | Golgi相关,含有ARF结合蛋白3的γadaptin耳朵3 | - | HPRD,Biogrid | 12505986 |
hun | - | 激素上调的NEU相关激酶 | - | HPRD,Biogrid | 11129044 |
Rab1a | DKFZP564B163 |Rab1 |YPT1 | Rab1a,Ras Oncogene家族成员 | 重构的复合物 | Biogrid | 11718716 |
rab33b | DKFZP434G099 |MGC138182 | Rab33b,Ras Oncogene家族成员 | - | HPRD,Biogrid | 11718716 |
Rab4a | HRES-1/RAB4 |rab4 | Rab4a,Ras Oncogene家族成员 | - | HPRD,Biogrid | 9524117 |
Rab5a | rab5 | Rab5a,Ras Oncogene家族成员 | 共纯化 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 8521472|9045618 |9524117|11718716 |
Rab5a | rab5 | Rab5a,Ras Oncogene家族成员 | - | HPRD | 8521472 | 9045618 |
Rabep1 | Rab5ep |Rabpt5 | Rabaptin,Rab GTPase结合效应蛋白1 | 共同分级 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9524117 |
Rabgef1 | FLJ32302 |Rabex5 |Rabex-5 | Rab鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)1 | - | HPRD | 12505986 |
TSC2 | FLJ43106 |林|TSC4 | 结节硬化2 | - | HPRD | 9045618 |
是的 | 14-3-3-GAMMA | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,伽马多肽 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
ywhaq | 14-3-3 |1c5 |HS1 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,theta多肽 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UEDA中央时钟 | 88 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛DN | 88 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hinata NFKB靶向成纤维细胞 | 84 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Poola侵入性乳腺癌DN | 134 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |