概括
基因 9135
象征 Rabep1
同义词 Rab5ep | Rabpt5
描述 Rabaptin,Rab GTPase结合效应蛋白1
参考 MIM:603616|HGNC:HGNC:17677|ENSEMBL:ENSG00000029725|HPRD:04684|Vega:Otthumg00000177870
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p13.2
Pascal P值 0.022
Sherlock P值 0.815
主持人 尾状基底神经节
小脑
皮质
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞内贩运
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9912506 CHR17 5199037 Rabep1 9135 0.19 顺式
RS3026109 CHR17 5284479 Rabep1 9135 0.02 顺式
RS1065483 CHR17 5284769 Rabep1 9135 0 顺式
RS1065483 CHR17 5284769 Rabep1 9135 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NCAPG 0.82 0.39
VRK1 0.78 0.45
C14orf23 0.75 0.35
ASF1A 0.72 0.56
tifa 0.72 0.36
PDE1A 0.71 0.37
RNF138 0.71 0.44
DDX59 0.70 0.50
HCRTR2 0.70 0.34
SNX6 0.69 0.51
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC9A3R2 -0.33 -0.31
tenc1 -0.32 -0.45
LGI4 -0.31 -0.28
ZBTB47 -0.31 -0.29
Bin1 -0.29 -0.22
CCDC88B -0.29 -0.33
AC018755.7 -0.28 -0.33
Suox -0.28 -0.06
PK4P -0.28 -0.28
AC013356.5 -0.28 -0.21

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
AP1G1 adtg |clapg1 |MGC18255 与Adaptor相关的蛋白质复合物1,伽马1亚基 重构的复合物
两个杂交
Biogrid 12042876|12505986
AP1G2 G2AD 与Adaptor相关的蛋白质复合物1,伽马2亚基 - HPRD 12505986
EEA1 MST105 |MSTP105 |ZFYVE2 早期内体抗原1 共同分级 Biogrid 10458612
GAP43 B-50 |PP46 生长蛋白43 - HPRD,Biogrid 9742146
GGA1 - Golgi相关,含有ARF结合蛋白1的γadaptin耳朵1 - HPRD,Biogrid 12505986
GGA2 FLJ20966 |KIAA1080 |vear Golgi相关,含有ARF结合蛋白2 - HPRD,Biogrid 10747088|11387476
|12505986
GGA3 KIAA0154 Golgi相关,含有ARF结合蛋白3的γadaptin耳朵3 - HPRD,Biogrid 12505986
hun - 激素上调的NEU相关激酶 - HPRD,Biogrid 11129044
Rab1a DKFZP564B163 |Rab1 |YPT1 Rab1a,Ras Oncogene家族成员 重构的复合物 Biogrid 11718716
rab33b DKFZP434G099 |MGC138182 Rab33b,Ras Oncogene家族成员 - HPRD,Biogrid 11718716
Rab4a HRES-1/RAB4 |rab4 Rab4a,Ras Oncogene家族成员 - HPRD,Biogrid 9524117
Rab5a rab5 Rab5a,Ras Oncogene家族成员 共纯化
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 8521472|9045618
|9524117|11718716
Rab5a rab5 Rab5a,Ras Oncogene家族成员 - HPRD 8521472 | 9045618
Rabep1 Rab5ep |Rabpt5 Rabaptin,Rab GTPase结合效应蛋白1 共同分级
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9524117
Rabgef1 FLJ32302 |Rabex5 |Rabex-5 Rab鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)1 - HPRD 12505986
TSC2 FLJ43106 |林|TSC4 结节硬化2 - HPRD 9045618
是的 14-3-3-GAMMA 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,伽马多肽 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
ywhaq 14-3-3 |1c5 |HS1 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,theta多肽 亲和力捕获ms Biogrid 17353931


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG内吞作用 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA中央时钟 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛DN 88 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔内B 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向成纤维细胞 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Poola侵入性乳腺癌DN 134 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
山乳房干细胞DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因