基因页：SLC6A5
概括？
| 基因 | 9152 |
| 象征 | SLC6A5 |
| 同义词 | glyt-2 | glyt2 | hkpx3 | net1 |
| 描述 | Solute Carrier家族6成员5 |
| 参考 | MIM：604159|HGNC：HGNC：11051|HPRD：08378| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11P15.1 |
| Pascal P值 | 0.882 |
| Sherlock P值 | 0.407 |
| 胎儿β | 0.145 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 神经递质代谢 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG20632573 | 11 | 20621341 | SLC6A5 | 1.6e-8 | -0.025 | 5.94E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2385509 | CHR1 | 237006972 | SLC6A5 | 9152 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ACSBG1 | 0.95 | 0.96 |
| SFXN5 | 0.93 | 0.92 |
| SLC13A5 | 0.92 | 0.88 |
| grin2c | 0.92 | 0.91 |
| ATP1A2 | 0.91 | 0.84 |
| ACOT11 | 0.91 | 0.90 |
| Scara3 | 0.90 | 0.82 |
| ACSS1 | 0.90 | 0.80 |
| ATP1B2 | 0.90 | 0.75 |
| SLC25A18 | 0.90 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Med19 | -0.68 | -0.80 |
| mllt11 | -0.68 | -0.80 |
| DUSP12 | -0.67 | -0.82 |
| ASNSD1 | -0.66 | -0.80 |
| Spats2 | -0.66 | -0.81 |
| ppp3cc | -0.65 | -0.79 |
| ube2e3 | -0.65 | -0.76 |
| GSTA4 | -0.65 | -0.81 |
| SUPV3L1 | -0.65 | -0.81 |
| rae1 | -0.65 | -0.77 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005328 | 神经递质：钠合作蛋白活性 | IEA | 神经递质（GO期限：9） | - |
| GO：0016855 | 种族酶和分配酶活性，作用于氨基酸和衍生物 | IEA | - | |
| GO：0015375 | 甘氨酸：钠合作蛋白活性 | 塔斯 | 9845349 | |
| GO：0015293 | 分类者活动 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 9845349 |
| 去：0006836 | 神经递质运输 | IEA | 神经元，神经递质（GO期限：5） | - |
| 去：0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 | 89 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Na Cl依赖性神经递质转运蛋白 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胺化合物SLC转运蛋白 | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| roversi神经胶质瘤区域 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Pons标记 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Medulla标记 | 81 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S2 | 115 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |