概括
基因 91603
象征 ZNF830
同义词 CCDC16 | OMCG1
描述 锌指蛋白830
参考 HGNC:HGNC:28291|HPRD:14469|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q12
Pascal P值 0.048
Sherlock P值 0.939
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00367659 17 33288544 ZNF830 5.52e-10 -0.032 8.9e-7 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4951059 CHR1 204258018 ZNF830 91603 0.06 反式
RS841285 CHR2 129330728 ZNF830 91603 0.14 反式
RS1155107 CHR3 26843376 ZNF830 91603 0.11 反式
RS1395163 CHR3 31028951 ZNF830 91603 0.08 反式
RS17029291 CHR3 32402138 ZNF830 91603 0.01 反式
RS830202 CHR3 165654796 ZNF830 91603 0.11 反式
RS16870339 CHR5 2705169 ZNF830 91603 0.04 反式
RS4617108 CHR7 49423831 ZNF830 91603 0.1 反式
RS3779536 CHR7 127233976 ZNF830 91603 0.03 反式
RS1954396 CHR14 43601835 ZNF830 91603 0.06 反式
RS4901739 CHR14 57345856 ZNF830 91603 0.19 反式
RS12441507 CHR15 61484028 ZNF830 91603 0.18 反式
RS1761450 CHR19 54818034 ZNF830 91603 0.05 反式
RS16996420 CHR20 9780867 ZNF830 91603 0.14 反式
RS6098023 CHR20 53113740 ZNF830 91603 0.02 反式
RS12157904 CHR22 37982011 ZNF830 91603 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌DN 181 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因