基因页:ZNF830
概括?
基因 | 91603 |
象征 | ZNF830 |
同义词 | CCDC16 | OMCG1 |
描述 | 锌指蛋白830 |
参考 | HGNC:HGNC:28291|HPRD:14469| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q12 |
Pascal P值 | 0.048 |
Sherlock P值 | 0.939 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00367659 | 17 | 33288544 | ZNF830 | 5.52e-10 | -0.032 | 8.9e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4951059 | CHR1 | 204258018 | ZNF830 | 91603 | 0.06 | 反式 | ||
RS841285 | CHR2 | 129330728 | ZNF830 | 91603 | 0.14 | 反式 | ||
RS1155107 | CHR3 | 26843376 | ZNF830 | 91603 | 0.11 | 反式 | ||
RS1395163 | CHR3 | 31028951 | ZNF830 | 91603 | 0.08 | 反式 | ||
RS17029291 | CHR3 | 32402138 | ZNF830 | 91603 | 0.01 | 反式 | ||
RS830202 | CHR3 | 165654796 | ZNF830 | 91603 | 0.11 | 反式 | ||
RS16870339 | CHR5 | 2705169 | ZNF830 | 91603 | 0.04 | 反式 | ||
RS4617108 | CHR7 | 49423831 | ZNF830 | 91603 | 0.1 | 反式 | ||
RS3779536 | CHR7 | 127233976 | ZNF830 | 91603 | 0.03 | 反式 | ||
RS1954396 | CHR14 | 43601835 | ZNF830 | 91603 | 0.06 | 反式 | ||
RS4901739 | CHR14 | 57345856 | ZNF830 | 91603 | 0.19 | 反式 | ||
RS12441507 | CHR15 | 61484028 | ZNF830 | 91603 | 0.18 | 反式 | ||
RS1761450 | CHR19 | 54818034 | ZNF830 | 91603 | 0.05 | 反式 | ||
RS16996420 | CHR20 | 9780867 | ZNF830 | 91603 | 0.14 | 反式 | ||
RS6098023 | CHR20 | 53113740 | ZNF830 | 91603 | 0.02 | 反式 | ||
RS12157904 | CHR22 | 37982011 | ZNF830 | 91603 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNF830_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |