基因页:Nexn
概括?
基因 | 91624 |
象征 | Nexn |
同义词 | CMH20 | Nelin |
描述 | Nexilin(F肌动蛋白结合蛋白) |
参考 | MIM:613121|HGNC:HGNC:29557|ENSEMBL:ENSG00000162614|HPRD:11388|Vega:Otthumg0000000040533 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p31.1 |
Pascal P值 | 0.033 |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02692 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | Nexn | 91624 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NEXN_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0051015 | 肌动蛋白丝结合 | IPI | 15823560 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0030334 | 细胞迁移的调节 | 艾达 | 15823560 | |
GO:0051493 | 细胞骨架组织的调节 | IEP | 15823560 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005924 | 细胞覆盖剂连接 | ISS | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOOI ST7靶向 | 94 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向DN | 133 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chebotaev gr目标dn | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yanagihara ESX1目标 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌F | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 | 75 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-325 | 78 | 84 | M8 | HSA-MIR-325 | ccuaguaguguccaguaagugu |
mir-328 | 156 | 162 | 1a | HSA-MIR-328脑 | cuggcccucugccuuccgu |