概括
基因 91624
象征 Nexn
同义词 CMH20 | Nelin
描述 Nexilin(F肌动蛋白结合蛋白)
参考 MIM:613121|HGNC:HGNC:29557|ENSEMBL:ENSG00000162614|HPRD:11388|Vega:Otthumg0000000040533
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p31.1
Pascal P值 0.033
主持人 皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 Nexn 91624 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0051015 肌动蛋白丝结合 IPI 15823560
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0030334 细胞迁移的调节 艾达 15823560
GO:0051493 细胞骨架组织的调节 IEP 15823560
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005856 细胞骨架 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005924 细胞覆盖剂连接 ISS -
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7靶向 94 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向DN 133 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标dn 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yanagihara ESX1目标 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌F 54 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-325 78 84 M8 HSA-MIR-325 ccuaguaguguccaguaagugu
mir-328 156 162 1a HSA-MIR-328 cuggcccucugccuuccgu