基因页:Myom2
概括?
基因 | 9172 |
象征 | Myom2 |
同义词 | ttnap |
描述 | 肌瘤2 |
参考 | MIM:603509|HGNC:HGNC:7614|Ensembl:ENSG0000000036448|HPRD:04619|Vega:Otthumg00000129175 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p23.3 |
Pascal P值 | 0.051 |
Sherlock P值 | 0.528 |
胎儿β | -1.583 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 下丘脑 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4876220 | 8 | 2075378 | Myom2 | ENSG0000000036448.5 | 1.14796E-6 | 0 | 82223 | gtex_brain_putamen_basal |
RS28718089 | 8 | 2076367 | Myom2 | ENSG0000000036448.5 | 3.16393E-7 | 0 | 83212 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6558609 | 8 | 2084053 | Myom2 | ENSG0000000036448.5 | 4.16077E-7 | 0 | 90898 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2099746 | 8 | 2095441 | Myom2 | ENSG0000000036448.5 | 7.56521E-7 | 0 | 102286 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6986035 | 8 | 2097403 | Myom2 | ENSG0000000036448.5 | 7.37044e-7 | 0 | 104248 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11136469 | 8 | 2100796 | Myom2 | ENSG0000000036448.5 | 7.5975E-9 | 0 | 107641 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferrando T与MLL融合一起 | 87 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kuninger IGF1与PDGFB的目标 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
雄鹿癌俯卧反应E2 | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Duan PRDM5目标 | 79 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemello Moleus vs EDL肌纤维DN | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |