概括
基因 9172
象征 Myom2
同义词 ttnap
描述 肌瘤2
参考 MIM:603509|HGNC:HGNC:7614|Ensembl:ENSG0000000036448|HPRD:04619|Vega:Otthumg00000129175
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p23.3
Pascal P值 0.051
Sherlock P值 0.528
胎儿β -1.583
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
下丘脑
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4876220 8 2075378 Myom2 ENSG0000000036448.5 1.14796E-6 0 82223 gtex_brain_putamen_basal
RS28718089 8 2076367 Myom2 ENSG0000000036448.5 3.16393E-7 0 83212 gtex_brain_putamen_basal
RS6558609 8 2084053 Myom2 ENSG0000000036448.5 4.16077E-7 0 90898 gtex_brain_putamen_basal
RS2099746 8 2095441 Myom2 ENSG0000000036448.5 7.56521E-7 0 102286 gtex_brain_putamen_basal
RS6986035 8 2097403 Myom2 ENSG0000000036448.5 7.37044e-7 0 104248 gtex_brain_putamen_basal
RS11136469 8 2100796 Myom2 ENSG0000000036448.5 7.5975E-9 0 107641 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL融合一起 87 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuninger IGF1与PDGFB的目标 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
雄鹿癌俯卧反应E2 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Duan PRDM5目标 79 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemello Moleus vs EDL肌纤维DN 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因