概括
基因 91752
象征 ZNF804A
同义词 C2orf10
描述 锌指蛋白804a
参考 MIM:612282|HGNC:HGNC:21711|ENSEMBL:ENSG00000170396|HPRD:12804|Vega:Otthumg00000132625
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q32.1
Pascal P值 1.088e-5
胎儿β 0.363
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:31

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS11693094 CHR2 185601420 TC 7.131E-12 内含子 ZNF804A

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS760521 CHR22 37247850 ZNF804A 91752 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线低剂量DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES HCP带有H3K27Me3 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1的Juban目标 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-25/32/92/363/367 435 441 1a HSA-MIR-25 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-493-5p 267 273 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-495 446 452 1a HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu