基因页：CHMP7
概括？
| 基因 | 91782 |
| 象征 | CHMP7 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 带电的多重体蛋白7 |
| 参考 | MIM：611130|HGNC：HGNC：28439|ENSEMBL：ENSG00000147457|HPRD：14534|Vega：Otthumg00000131785 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8p21.3 |
| Pascal P值 | 0.25 |
| Sherlock P值 | 0.205 |
| 胎儿β | 0.998 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.031 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.00057 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.03086 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24810594 | 8 | 23104082 | CHMP7 | 2.913E-4 | -0.259 | 0.039 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17350188 | CHR2 | 73964841 | CHMP7 | 91782 | 0.17 | 反式 | ||
| RS12624267 | CHR2 | 73986930 | CHMP7 | 91782 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0008565 | 蛋白质转运蛋白活性 | 小鬼 | 16856878 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
| GO：0045324 | 内体晚期到液泡运输 | 小鬼 | 16856878 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0000815 | ESCRT III复合物 | 艾达 | 16856878 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组内体分选复合物需要运输escrt | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chemnitz对前列腺素E2的反应 | 146 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔卡拉凋亡 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chauhan对甲氧雌二醇的反应 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-219 | 1342 | 1348 | 1a | HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu |
| mir-25/32/92/363/367 | 971 | 978 | 1A，M8 | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
| HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
| HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
| HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
| HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
| mir-31 | 280 | 287 | 1A，M8 | HSA-MIR-31 | Aggcaagaugcuggcauagcug |
| mir-34/449 | 1159 | 1166 | 1A，M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
| HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
| HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
| HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
| mir-488 | 123 | 130 | 1A，M8 | HSA-MIR-488 | cccagauauggcacucucucaa |