基因页:DDX21
概括?
基因 | 9188 |
象征 | DDX21 |
同义词 | gua | gurdb | rh-ii/gu | rh-ii/gua |
描述 | 死盒解旋酶21 |
参考 | MIM:606357|HGNC:HGNC:2744|ENSEMBL:ENSG00000165732|HPRD:05895|Vega:Otthumg0000000018366 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q21 |
Pascal P值 | 7.78e-5 |
Sherlock P值 | 0.697 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 3 |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02522627 | 10 | 70715883 | DDX21 | 2.61E-9 | -0.019 | 1.91E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
CG13607473 | 10 | 70715830 | DDX21 | 2.45e-8 | -0.017 | 7.95e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
CG13409216 | 10 | 70939987 | DDX21 | 0.002 | -5.54 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DDX21_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
六 | 0.87 | 0.81 |
HMG20B | 0.83 | 0.73 |
PKN3 | 0.81 | 0.67 |
EPHB4 | 0.81 | 0.68 |
NFATC4 | 0.81 | 0.79 |
CDK2 | 0.80 | 0.45 |
SOX2 | 0.80 | 0.68 |
Rab13 | 0.80 | 0.73 |
tead2 | 0.79 | 0.42 |
smo | 0.79 | 0.70 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FBXW7 | -0.40 | -0.49 |
FGF12 | -0.39 | -0.48 |
serpini1 | -0.39 | -0.47 |
ephx4 | -0.39 | -0.47 |
KCNV1 | -0.38 | -0.50 |
LNX1 | -0.38 | -0.47 |
TMEM70 | -0.38 | -0.47 |
NPM2 | -0.37 | -0.36 |
RGS7 | -0.37 | -0.44 |
SLC26A4 | -0.37 | -0.49 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoebeke淋巴干细胞向上 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶标和血清反应DN | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
真菌IL2信号2 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Simbulan UV响应永生的DN | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过HIF1A的总缺氧 | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Menssen MYC目标 | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn beta响应 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuhmacher MYC的目标 | 80 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bhattacharya胚胎干细胞 | 89 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对姜黄素Sulindac 7的反应 | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aprelikova BRCA1目标 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mulligan NTF3通过INSR和IGF1R发出信号 | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期16小时 | 40 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应11 | 103 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |