概括
基因 9194
象征 SLC16A7
同义词 MCT2
描述 Solute Carrier家族16成员7
参考 MIM:603654|HGNC:HGNC:10928|Ensembl:ENSG00000118596|HPRD:06791|Vega:Otthumg00000169923
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q13
Pascal P值 0.724
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07614306 12 59990159 SLC16A7 5.71E-9 -0.011 3.12E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16869851 CHR4 20690056 SLC16A7 9194 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CXXC1 0.95 0.95
RBM10 0.95 0.93
daxx 0.95 0.95
EHMT2 0.94 0.94
PRPF31 0.94 0.94
U2AF2 0.94 0.94
DVL3 0.93 0.92
VPS16A 0.93 0.93
MTA1 0.93 0.93
UNC45A 0.93 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.79 -0.88
AF347015.27 -0.78 -0.89
MT-CO2 -0.78 -0.88
AF347015.33 -0.76 -0.85
mt-cyb -0.76 -0.86
AF347015.8 -0.76 -0.87
AF347015.15 -0.73 -0.86
AF347015.21 -0.72 -0.89
AF347015.2 -0.72 -0.86
C5orf53 -0.70 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 89 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胆汁盐和有机阴离子SLC转运蛋白 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨型性白血病DN 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1目标DN 47 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAI对肿瘤转移的耐药性 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HALMOS CEBPA目标 52 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Traynor Rett综合征 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔衰老肾脏无血DN 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McCollum geldanamycin抗性 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类多肌膜7 DN 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤神经 129 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因