基因页面:COG7
总结吗?
GeneID | 91949年 |
象征 | COG7 |
同义词 | CDG2E |
描述 | 组件的低聚物的高尔基氏复合体7 |
参考 | MIM: 606978|HGNC: HGNC: 18622|运用:ENSG00000168434|HPRD: 07373|织女:OTTHUMG00000094807 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 p12.2 |
帕斯卡假定值 | 0.088 |
胎儿β | -0.188 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01775 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
COG7 | chr16 | 23430055 | C | T | NM_153603 | p.368S > N | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg04723449 | 16 | 23420567 | COG7 | 3.125的军医 | 0.494 | 0.04 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/COG7_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 15047703 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006486 | 氨基酸的蛋白质糖基化 | 小鬼 | 15107842|16420527 | |
去:0034067 | 蛋白定位在高尔基体 | 小鬼 | 16510524 | |
去:0006886 | 细胞内蛋白质的运输 | 小鬼 | 15107842 | |
去:0006890 | 逆行vesicle-mediated运输、高尔基ER | 小鬼 | 16420527|16510524 | |
去:0050821 | 蛋白质的稳定 | 小鬼 | 16420527|16510524 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 11980916 | |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0017119 | 高尔基体运输复杂 | 艾达 | 15047703 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质 | 450年 | 256年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BALLIF发育障碍P16 P12删除 | 13 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染48小时血巨细胞病毒DN | 504年 | 323年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗2 | 473年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN | 254年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |