基因页面:LRRFIP2

总结吗?
GeneID 9209年
象征 LRRFIP2
同义词 HUFI-2
描述 富亮氨酸重复(FLII)相互作用的蛋白质2
参考 MIM: 614043|HGNC: HGNC: 6703|运用:ENSG00000093167|HPRD: 10061|织女:OTTHUMG00000130796
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 3 p22.2
帕斯卡假定值 0.002
夏洛克假定值 0.978
eGene 迈尔斯的顺式和反式
元

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.006

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs17202548 chr3 36995986 LRRFIP2 9209年 0.08 独联体
rs4647269 chr3 37057590 LRRFIP2 9209年 0.03 独联体
rs3774339 chr3 37062853 LRRFIP2 9209年 0.03 独联体
rs3774326 chr3 37099565 LRRFIP2 9209年 0.14 独联体
rs11720064 chr3 37101518 LRRFIP2 9209年 0.08 独联体
rs1468712 chr3 37106012 LRRFIP2 9209年 0.07 独联体
rs7651033 chr3 37116041 LRRFIP2 9209年 0.03 独联体
rs2302504 chr3 37116385 LRRFIP2 9209年 0.1 独联体
rs17204801 chr3 37143433 LRRFIP2 9209年 0.02 独联体
rs6800554 chr3 37143878 LRRFIP2 9209年 0.18 独联体
rs9869432 chr3 37196600 LRRFIP2 9209年 0.05 独联体
rs1392749 chr3 37205190 LRRFIP2 9209年 0.07 独联体
rs11711937 chr3 37224837 LRRFIP2 9209年 0.05 独联体
rs6800842 chr3 37289603 LRRFIP2 9209年 0.16 独联体
rs4678564 chr3 37437303 LRRFIP2 9209年 0.08 独联体

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
GAK 0.91 0.91
AP3D1 0.89 0.89
ARFGAP1 0.89 0.88
LPHN1 0.89 0.92
KIAA0664 0.89 0.89
CABIN1 0.89 0.90
CES2 0.88 0.88
LRRC68 0.88 0.89
PPAN-P2RY11 0.88 0.90
DNAJC11 0.88 0.87
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.73 -0.69
AF347015.31 -0.71 -0.64
C1orf54 -0.68 -0.68
MT-CO2 -0.68 -0.62
AF347015.27 -0.66 -0.62
GNG11 -0.65 -0.63
AF347015.8 -0.64 -0.60
AF347015.33 -0.64 -0.57
MT-CYB -0.64 -0.58
HIGD1B -0.64 -0.58

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 15677333
去:0030275 远程雷达域绑定 NAS 10366446
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016055 Wnt受体信号通路 国际能源机构 - - - - - -
去:0008150 biological_process ND - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005575 cellular_component ND - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
开回应前列腺素E2 DN 391年 222年 所有SZGR 2.0基因通路
DAVICIONI分子武器VS erm 332年 228年 所有SZGR 2.0基因通路
DN HOOI ST7目标 123年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN 663年 425年 所有SZGR 2.0基因通路
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 1382年 904年 所有SZGR 2.0基因通路
EBAUER目标PAX3 FOXO1融合DN 48 31日 所有SZGR 2.0基因通路
乔治MIR192和MIR215的目标 893年 528年 所有SZGR 2.0基因通路
BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 882年 572年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病了布莱洛克的 1691年 1088年 所有SZGR 2.0基因通路
CREIGHTON内分泌治疗抵抗1 528年 324年 所有SZGR 2.0基因通路
由4 nqo KYNG DNA损伤或γ辐射 15 13 所有SZGR 2.0基因通路
KYNG DNA损伤了 226年 164年 所有SZGR 2.0基因通路
恩格尔曼氏癌症祖细胞DN 70年 44 所有SZGR 2.0基因通路
BONOME卵巢癌生存非最优减积 510年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
研究包括 420年 269年 所有SZGR 2.0基因通路
蒋介石肝癌未经子类 85年 50 所有SZGR 2.0基因通路
DUTERTRE雌二醇反应6小时 229年 149年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应迟 1137年 655年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 101 86年 92年 m8 hsa - mir - 101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
miR-124/506 392年 398年 m8 hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-15/16/195/424/497 730年 736年 m8 hsa-miR-15a大脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
hsa-miR-16大脑 UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
hsa-miR-15b大脑 UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA
hsa - mir - 195深圳 UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
hsa - mir - 424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
hsa - mir - 497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir - 378 * 644年 650年 m8 hsa - mir - 422 b CUGGACUUGGAGUCAGAAGGCC
hsa - mir - 422 a CUGGACUUAGGGUCAGAAGGCC
mir - 410 573年 579年 1 hsa - mir - 410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
mir - 494 512年 519年 1、m8 hsa - mir - 494大脑 UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU