基因页:CD5
Summary?
基因ID | 921 |
象征 | CD5 |
同义词 | Leu1 | T1 |
描述 | CD5分子 |
参考 | MIM:153340|HGNC:HGNC:1685|ENSEMBL:ENSG00000110448|HPRD:01078|Vega:Otthumg00000167825 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q13 |
Pascal P值 | 0.464 |
胎儿β | -0.062 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0226 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24674703 | 11 | 60869960 | CD5 | 1.44e-5 | -4.592 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CD5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
podnl1 | 0.74 | 0.23 |
KLK10 | 0.71 | 0.21 |
EGFL6 | 0.67 | 0.15 |
GPR177 | 0.66 | 0.04 |
MAP4K1 | 0.66 | 0.19 |
anxa3 | 0.66 | 0.36 |
OTX2 | 0.66 | 0.11 |
HSD11B2 | 0.66 | 0.23 |
ano2 | 0.65 | 0.10 |
CEACAM21 | 0.64 | 0.20 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GTDC1 | -0.31 | -0.35 |
EMX1 | -0.30 | -0.38 |
SATB1 | -0.28 | -0.36 |
arl4d | -0.28 | -0.34 |
Arhgef2 | -0.27 | -0.32 |
C1orf96 | -0.27 | -0.33 |
克里姆 | -0.27 | -0.32 |
ZNF238 | -0.27 | -0.35 |
MEF2C | -0.26 | -0.34 |
LMO7 | -0.26 | -0.33 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005044 | 清道夫受体活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 1711157 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008283 | 细胞增殖 | nas | 3093892 | |
去:0008037 | 细胞识别 | nas | 1711157 | |
去:0008624 | 通过细胞外信号诱导凋亡 | IEA | - | |
GO:0031295 | T细胞共刺激 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0009897 | 质膜的外侧 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 11390434 | |
去:0005887 | 质膜的积分 | nas | 1711157 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CAMK2D | camkd |DKFZP686G23119 |DKFZP686I2288 |MGC44911 | 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶II三角洲 | 体外 两个杂交 |
Biogrid | 9692886 |
CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | - | HPRD,Biogrid | 9603468 |
张 | SRBC |T11 | CD2分子 | - | HPRD,Biogrid | 10510361 |
张47 | CD3-Zeta |CD3H |CD3Q |CD3Z |T3z |TCRZ | CD247分子 | - | HPRD | 1385158 |
CD27 | MGC20393 |S152 |T14 |TNFRSF7 |TP55 | CD27分子 | 重构的复合物 | Biogrid | 1711157 |
CD4 | CD4MUT | CD4分子 | - | HPRD | 7539755 |
CD6 | FLJ44171 |TP120 | CD6分子 | - | HPRD,Biogrid | 12473675 |
CD72 | CD72B |Lyb2 | CD72分子 | - | HPRD | 1711157|8806810 |
Dynlt3 | rp3 |TCTE1L |TCTEX1L | Dynein,轻链,TCTEX型3 | - | HPRD,Biogrid | 9692886 |
LCK | yt16 |p56lck |pp58lck | 淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶 | - | HPRD | 7513045 |
PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | - | HPRD,Biogrid | 9079809 |
PTPN6 | HCP | HCPH | HPTP1C | PTP-1C | SH-PTP1 | SHP-1 | SHP-1L | SHP1 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 | - | HPRD,Biogrid | 10082557 |
rasa1 | CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP | Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 | - | HPRD,Biogrid | 9603468 |
ZAP70 | FLJ17670 |FLJ17679 |SRK |std |tzk |ZAP-70 | Zeta链(TCR)相关蛋白激酶70KDA | - | HPRD,Biogrid | 9378960 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG造血细胞谱系 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta DC途径 | 22 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HUTTMANN B CLL POOR SURVIVAL UP | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
柄塔尔1靶向DN | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon | 158 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周TNF信号30分钟 | 54 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO TH1细胞毒性模块 | 114 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |