Summary
基因ID 921
象征 CD5
同义词 Leu1 | T1
描述 CD5分子
参考 MIM:153340|HGNC:HGNC:1685|ENSEMBL:ENSG00000110448|HPRD:01078|Vega:Otthumg00000167825
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13
Pascal P值 0.464
胎儿β -0.062
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
皮质

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0226

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24674703 11 60869960 CD5 1.44e-5 -4.592 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
podnl1 0.74 0.23
KLK10 0.71 0.21
EGFL6 0.67 0.15
GPR177 0.66 0.04
MAP4K1 0.66 0.19
anxa3 0.66 0.36
OTX2 0.66 0.11
HSD11B2 0.66 0.23
ano2 0.65 0.10
CEACAM21 0.64 0.20
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GTDC1 -0.31 -0.35
EMX1 -0.30 -0.38
SATB1 -0.28 -0.36
arl4d -0.28 -0.34
Arhgef2 -0.27 -0.32
C1orf96 -0.27 -0.33
克里姆 -0.27 -0.32
ZNF238 -0.27 -0.35
MEF2C -0.26 -0.34
LMO7 -0.26 -0.33

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005044 清道夫受体活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 1711157
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008283 细胞增殖 nas 3093892
去:0008037 细胞识别 nas 1711157
去:0008624 通过细胞外信号诱导凋亡 IEA -
GO:0031295 T细胞共刺激 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009897 质膜的外侧 IEA -
去:0005886 质膜 艾达 11390434
去:0005887 质膜的积分 nas 1711157

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CAMK2D camkd |DKFZP686G23119 |DKFZP686I2288 |MGC44911 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶II三角洲 体外
两个杂交
Biogrid 9692886
CBL C-CBL |CBL2 |RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 - HPRD,Biogrid 9603468
SRBC |T11 CD2分子 - HPRD,Biogrid 10510361
张47 CD3-Zeta |CD3H |CD3Q |CD3Z |T3z |TCRZ CD247分子 - HPRD 1385158
CD27 MGC20393 |S152 |T14 |TNFRSF7 |TP55 CD27分子 重构的复合物 Biogrid 1711157
CD4 CD4MUT CD4分子 - HPRD 7539755
CD6 FLJ44171 |TP120 CD6分子 - HPRD,Biogrid 12473675
CD72 CD72B |Lyb2 CD72分子 - HPRD 1711157|8806810
Dynlt3 rp3 |TCTE1L |TCTEX1L Dynein,轻链,TCTEX型3 - HPRD,Biogrid 9692886
LCK yt16 |p56lck |pp58lck 淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶 - HPRD 7513045
PIK3R1 grb1 |P85 |p85-alpha 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) - HPRD,Biogrid 9079809
PTPN6 HCP | HCPH | HPTP1C | PTP-1C | SH-PTP1 | SHP-1 | SHP-1L | SHP1 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 - HPRD,Biogrid 10082557
rasa1 CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 - HPRD,Biogrid 9603468
ZAP70 FLJ17670 |FLJ17679 |SRK |std |tzk |ZAP-70 Zeta链(TCR)相关蛋白激酶70KDA - HPRD,Biogrid 9378960


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG造血细胞谱系 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta DC途径 22 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUTTMANN B CLL POOR SURVIVAL UP 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
柄塔尔1靶向DN 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon 158 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周TNF信号30分钟 54 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO TH1细胞毒性模块 114 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因