基因页面:MTSS1L
总结吗?
GeneID | 92154年 |
象征 | MTSS1L |
同义词 | ABBA-1 |
描述 | 转移抑制因子1 |
参考 | HGNC: HGNC: 25094|运用:ENSG00000132613|HPRD: 14289|织女:OTTHUMG00000177023 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 q22.1 |
帕斯卡假定值 | 0.096 |
胎儿β | -0.359 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 皮质 |
支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg09204302 | 16 | 70713462 | MTSS1L | 1.747的军医 | 0.372 | 0.033 | DMG: Wockner_2014 |
cg16757605 | 16 | 70697712 | MTSS1L | 4.278的军医 | 0.508 | 0.045 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MTSS1L_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0046847 | 外肉伪足的形成 | 国际能源机构 | 轴突(词级:10) | - - - - - - |
去:0007399 | 神经系统发育 | 国际能源机构 | 神经突(术语层面:5) | - - - - - - |
去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
GINESTIER乳腺癌ZNF217放大DN | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SENESE HDAC1目标 | 260年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SENESE HDAC3目标 | 536年 | 332年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BERENJENO改变了RHOA DN | 394年 | 258年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿布得生活信号1 DN | 26 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
甜蜜的肺癌喀斯特DN | 435年 | 289年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
杜兰基质年代了 | 297年 | 194年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-10 | 974年 | 980年 | m8 | hsa-miR-10a | UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG |
hsa-miR-10b | UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU | ||||
mir - 101 | 2459年 | 2466年 | 1、m8 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
mir - 127 | 2085年 | 2092年 | 1、m8 | hsa - mir - 127大脑 | UCGGAUCCGUCUGAGCUUGGCU |
mir - 128 | 2429年 | 2436年 | 1、m8 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
mir - 144 | 2460年 | 2466年 | 1 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
miR-148/152 | 2427年 | 2433年 | m8 | hsa - mir - 148 a | UCAGUGCACUACAGAACUUUGU |
hsa - mir - 152大脑 | UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG | ||||
hsa - mir - 148 b | UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU | ||||
mir - 186 | 2169年 | 2175年 | m8 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
mir - 200 bc / 429 | 2443年 | 2450年 | 1、m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
miR-27 | 2430年 | 2437年 | 1、m8 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
miR-29 | 2208年 | 2214年 | m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU |