基因页面:LRAT
总结吗?
GeneID | 9227年 |
象征 | LRAT |
同义词 | LCA14 |
描述 | 卵磷脂视黄醇酰基转移酶(磷脂酰胆碱——视黄醇O-acyltransferase) |
参考 | MIM: 604863|HGNC: HGNC: 6685|运用:ENSG00000121207|HPRD: 05332|织女:OTTHUMG00000161418 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 4 q32.1 |
帕斯卡假定值 | 0.637 |
胎儿β | -0.973 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 0 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
---|
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LRAT_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ICAM5 | 0.87 | 0.86 |
TMEM59L | 0.87 | 0.88 |
PRKCG | 0.86 | 0.89 |
RASAL1 | 0.84 | 0.85 |
PRRT1 | 0.83 | 0.90 |
IL34 | 0.83 | 0.77 |
SYT17 | 0.83 | 0.80 |
ARHGEF4 | 0.83 | 0.85 |
FMNL1 | 0.82 | 0.85 |
PLD3 | 0.82 | 0.78 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RBMX2 | -0.49 | -0.57 |
KIAA1949 | -0.46 | -0.32 |
CARHSP1 | -0.46 | -0.49 |
DYNLT1 | -0.45 | -0.50 |
IGF2BP3 | -0.45 | -0.33 |
TMSB15A | -0.45 | -0.40 |
TUBB2B | -0.45 | -0.42 |
ZNF491 | -0.44 | -0.36 |
EZH2 | -0.44 | -0.40 |
BAZ1A | -0.44 | -0.65 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG视黄醇新陈代谢 | 64年 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID锥通路 | 23 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID视紫红质通路 | 24 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME代谢类固醇激素和维生素A和D | 35 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME代谢脂质和脂蛋白 | 478年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAUSSMANN MLL AF4融合目标G | 238年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH OCT4目标 | 290年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH号目标 | 179年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
《图片报》极品致癌签名 | 261年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |