基因页面:DLGAP2
总结吗?
| GeneID | 9228年 |
| 象征 | DLGAP2 |
| 同义词 | DAP2 | SAPAP2 |
| 描述 | 光盘大同族体相关蛋白2 |
| 参考 | MIM: 605438|HGNC: HGNC: 2906|运用:ENSG00000198010|HPRD: 09258|织女:OTTHUMG00000163599 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 8 p23 |
| 帕斯卡假定值 | 0.127 |
| 夏洛克假定值 | 0.983 |
| 胎儿β | -2.177 |
| DMG | 2(#研究) |
| 支持 | 蛋白质聚类 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_clathrin G2Cdb.human_Synaptosome g2cdb.human_tap psd - 95核心 G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet 达内尔FMRP目标 潜在的突触基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:3 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg23042540 | 8 | 1653566 | DLGAP2 | 3.598的军医 | -0.324 | 0.042 | DMG: Wockner_2014 |
| cg25633955 | 8 | 1616622 | DLGAP2 | 1.03 e - | 0.025 | 2.28 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| EIF6 | 0.88 | 0.89 |
| EBP | 0.88 | 0.87 |
| TBCB | 0.88 | 0.88 |
| DCTPP1 | 0.87 | 0.87 |
| DCTN3 | 0.86 | 0.86 |
| DCTN2 | 0.86 | 0.88 |
| EEF1B2 | 0.85 | 0.84 |
| PSMA7 | 0.85 | 0.86 |
| EIF2B3 | 0.85 | 0.89 |
| PSMD13 | 0.85 | 0.87 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.26 | -0.68 | -0.80 |
| MT-CYB | -0.68 | -0.76 |
| AF347015.8 | -0.67 | -0.75 |
| AF347015.15 | -0.67 | -0.77 |
| AF347015.2 | -0.67 | -0.76 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.75 |
| AF347015.27 | -0.66 | -0.75 |
| MT-CO2 | -0.66 | -0.72 |
| AF347015.31 | -0.65 | -0.72 |
| AF347015.9 | -0.62 | -0.73 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | NAS | 10759891 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007270 | nerve-nerve突触传递 | NAS | 神经元,Synap(术语层面:7) | 9694864 |
| 去:0007267 | 信息信号 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005883 | 神经丝 | NAS | 神经元,轴突(术语层面:11) | 10759891 |
| 去:0045211 | 突触后膜 | 国际能源机构 | Synap,神经递质(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0045202 | 突触 | 国际能源机构 | Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) | - - - - - - |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DAVICIONI分子武器VS erm | 332年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除 | 195年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病早期布莱洛克的DN | 165年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和T 8 21易位 | 368年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-10 | 945年 | 951年 | 1 | hsa-miR-10a | UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG |
| hsa-miR-10b | UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU | ||||
| mir - 124.1 | 1837年 | 1843年 | 1 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir - 129 - 5 - p | 1857年 | 1863年 | m8 | hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC |
| hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
| hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC | ||||
| hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
| mir - 135 | 2651年 | 2657年 | m8 | hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| mir - 153 | 1117年 | 1123年 | m8 | hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 1567年 | 1574年 | 1、m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| mir - 181 | 1871年 | 1877年 | 1 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
| hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
| hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
| mir - 182 | 6428年 | 6434年 | 1 | hsa - mir - 182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
| mir - 217 | 1119年 | 1126年 | 1、m8 | hsa - mir - 217 | UACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAU |
| miR-23 | 1034年 | 1040年 | m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-25/32/92/363/367 | 2596年 | 2603年 | 1、m8 | hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| mir - 323 | 1034年 | 1040年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 326 | 1943年 | 1949年 | m8 | hsa - mir - 326 | CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG |
| miR-33 | 1889年 | 1895年 | 1 | hsa-miR-33 | GUGCAUUGUAGUUGCAUUG |
| hsa-miR-33b | GUGCAUUGCUGUUGCAUUGCA | ||||
| mir - 381 | 5688年 | 5694年 | 1 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
| mir - 450 | 1892年 | 1898年 | 1 | hsa - mir - 450 | UUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUA |
| hsa - mir - 450 | UUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUA | ||||
| miR-9 | 2515年 | 2521年 | 1 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |
| mir - 96 | 6427年 | 6434年 | 1、m8 | hsa - mir - 96大脑 | UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC |