概括
基因 92335
象征 斯特拉达
同义词 lyk5 | ny-br-96 | pmse | strad | stlk
描述 与Ste20相关的激酶适配器alpha
参考 MIM:608626|HGNC:HGNC:30172|ENSEMBL:ENSG00000266173|HPRD:14332|Vega:Otthumg00000178908
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q23.3
Pascal P值 0.096
Sherlock P值 3.517E-4
胎儿β 0.237
DMG 2(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 4
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 4

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24542492 17 61818870 斯特拉达 4.13e-5 -0.405 0.021 DMG:Wockner_2014
CG05486193 17 61819520 斯特拉达 1.09E-10 -0.021 4.65e-7 DMG:JAFFE_2016
CG16306381 17 61819073 斯特拉达 1.95E-9 -0.009 1.62E-6 DMG:JAFFE_2016
CG07659893 17 61819838 斯特拉达 4.54e-8 -0.012 1.24e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12677942 CHR8 31539941 斯特拉达 92335 0.12 反式
RS16878286 CHR8 31646175 斯特拉达 92335 0.17 反式
RS16878317 CHR8 31657853 斯特拉达 92335 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mtor信号通路 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LKB1途径 47 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组激活的AMPK刺激肌肉中的脂肪酸氧化 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过LKB1对AMPK活性的反应组调节 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lkb1 ampk对MTOR的反应组能量依赖性调节 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PKB介导的事件 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素受体的反应组信号传导 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PI3K级联 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因