基因页:斯特拉达
概括?
基因 | 92335 |
象征 | 斯特拉达 |
同义词 | lyk5 | ny-br-96 | pmse | strad | stlk |
描述 | 与Ste20相关的激酶适配器alpha |
参考 | MIM:608626|HGNC:HGNC:30172|ENSEMBL:ENSG00000266173|HPRD:14332|Vega:Otthumg00000178908 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q23.3 |
Pascal P值 | 0.096 |
Sherlock P值 | 3.517E-4 |
胎儿β | 0.237 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 4 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24542492 | 17 | 61818870 | 斯特拉达 | 4.13e-5 | -0.405 | 0.021 | DMG:Wockner_2014 |
CG05486193 | 17 | 61819520 | 斯特拉达 | 1.09E-10 | -0.021 | 4.65e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
CG16306381 | 17 | 61819073 | 斯特拉达 | 1.95E-9 | -0.009 | 1.62E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
CG07659893 | 17 | 61819838 | 斯特拉达 | 4.54e-8 | -0.012 | 1.24e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12677942 | CHR8 | 31539941 | 斯特拉达 | 92335 | 0.12 | 反式 | ||
RS16878286 | CHR8 | 31646175 | 斯特拉达 | 92335 | 0.17 | 反式 | ||
RS16878317 | CHR8 | 31657853 | 斯特拉达 | 92335 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mtor信号通路 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID LKB1途径 | 47 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组激活的AMPK刺激肌肉中的脂肪酸氧化 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胰岛素受体信号传导级联 | 87 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过LKB1对AMPK活性的反应组调节 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lkb1 ampk对MTOR的反应组能量依赖性调节 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PKB介导的事件 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素受体的反应组信号传导 | 108 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PI3K级联 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |