基因页：CD7

概括？
基因 924
象征 CD7
同义词 GP40 | Leu-9 | TP41 | TP40
描述 CD7分子
参考 MIM：186820|HGNC：HGNC：1695|ENSEMBL：ENSG00000173762|HPRD：01732|Vega：Otthumg00000178662
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q25.2-Q25.3
Pascal P值 0.432
胎儿β 0.186
DMG 1（＃研究）
主持人 前扣带回皮层BA24

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG18345635 17 80186080 CD7 3.305E-4 8.668 DMG：Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS34843029 17 81071421 CD7 ENSG00000173762.3 5.597E-7 0.01 -795943 gtex_brain_ba24
RS35798026 17 81071436 CD7 ENSG00000173762.3 2.381E-7 0.01 -795958 gtex_brain_ba24
RS140646675 17 81071621 CD7 ENSG00000173762.3 3.448e-7 0.01 -796143 gtex_brain_ba24
RS35793360 17 81071826 CD7 ENSG00000173762.3 1.804E-6 0.01 -796348 gtex_brain_ba24
RS77572283 17 81072094 CD7 ENSG00000173762.3 4.398E-7 0.01 -796616 gtex_brain_ba24
RS77182059 17 81072675 CD7 ENSG00000173762.3 2.029E-7 0.01 -797197 gtex_brain_ba24
RS71193767 17 81075004 CD7 ENSG00000173762.3 8.991E-7 0.01 -799526 gtex_brain_ba24
RS12950942 17 81075573 CD7 ENSG00000173762.3 2.462E-7 0.01 -800095 gtex_brain_ba24
RS9902102 17 81075836 CD7 ENSG00000173762.3 3.534e-7 0.01 -800358 gtex_brain_ba24
RS9747886 17 81076641 CD7 ENSG00000173762.3 8.382e-7 0.01 -801163 gtex_brain_ba24
RS35088461 17 81076658 CD7 ENSG00000173762.3 1.735E-6 0.01 -801180 gtex_brain_ba24
RS12946950 17 81077361 CD7 ENSG00000173762.3 3.712E-7 0.01 -801883 gtex_brain_ba24
RS9674881 17 81078568 CD7 ENSG00000173762.3 2.797E-7 0.01 -803090 gtex_brain_ba24
RS9330533 17 81078768 CD7 ENSG00000173762.3 1.346E-6 0.01 -803290 gtex_brain_ba24
RS9797117 17 81079015 CD7 ENSG00000173762.3 7.771E-7 0.01 -803537 gtex_brain_ba24
RS12946146 17 81079703 CD7 ENSG00000173762.3 1.185E-6 0.01 -804225 gtex_brain_ba24
RS9330534 17 81080779 CD7 ENSG00000173762.3 1.396E-6 0.01 -805301 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FOLR2 0.81 0.75
HCK 0.79 0.68
PTPN6 0.79 0.70
NCF4 0.78 0.72
CD68 0.77 0.64
ITGB2 0.75 0.70
FCGR2A 0.74 0.63
FERMT3 0.72 0.68
CTSC 0.72 0.70
CSF3R 0.71 0.62
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC005921.3 -0.27 -0.46
AC010300.1 -0.27 -0.32
anp32c -0.26 -0.36
EIF5B -0.24 -0.41
AC145146.3 -0.24 -0.27
CLK1 -0.23 -0.27
SFRS18 -0.22 -0.36
Neurod6 -0.22 -0.16
ankrd36 -0.22 -0.35
klhl1 -0.22 -0.15

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG造血细胞谱系 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta DC途径 22 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St FAS信号通路 65 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2 DN 77 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔卡拉凋亡 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN 63 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tavor Cebpa靶向 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU遗传毒性损伤24小时 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P2 79 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质癌与腺瘤DN 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vilimas Notch1靶向 52 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马歇尔病毒感染反应dn 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集4 31 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
cebpa的valk aml 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因