基因页：木栓
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| 基因ID | 9241 |
| Symbol | 木栓 |
| 同义词 | SYM1|SYNS1|SYNS1A |
| 描述 | Noggin |
| 参考 | MIM：602991|HGNC：HGNC：7866|ENSEMBL：ENSG00000183691|HPRD：04291|Vega：Otthumg00000151770 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q22 |
| Pascal P值 | 0.143 |
| 胎儿β | 0.182 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 简历：Phewas | 全球整个关联研究（PHEWAS） | 157个与精神分裂症相关的SNP | 0 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 2 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
简历：Phewas
简历：Phewas| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | Function | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC6A20 | 0.81 | 0.56 |
| SLC22A2 | 0.75 | 0.63 |
| SLC13A4 | 0.73 | 0.78 |
| SLC5A5 | 0.69 | 0.77 |
| OGN | 0.66 | 0.69 |
| DSP | 0.62 | 0.56 |
| serpind1 | 0.61 | 0.69 |
| GJB2 | 0.60 | 0.60 |
| SLC22A6 | 0.59 | 0.69 |
| OMD | 0.59 | 0.54 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LRRC37A | -0.18 | -0.36 |
| CHMP4A | -0.17 | -0.30 |
| NBR2 | -0.17 | -0.20 |
| C11orf51 | -0.14 | -0.23 |
| ACP6 | -0.14 | -0.06 |
| USF2 | -0.13 | -0.31 |
| ZRSR2 | -0.13 | -0.36 |
| HES4 | -0.13 | -0.23 |
| SLC25A28 | -0.13 | -0.17 |
| C14ORF80 | -0.13 | -0.15 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | pubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0019955 | 细胞因子结合 | IPI | 8752214 | |
| GO：0042803 | 蛋白质同构化活性 | 艾达 | 11562478 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | pubMed ID |
| 去：0007420 | 大脑发育 | IEA | 大脑（GO期限：7） | - |
| GO：0048712 | negative regulation of astrocyte differentiation | ISS | 星形胶质细胞，神经胶质（GO期限：12） | 10780858 |
| 去：0001657 | ureteric bud development | IEA | - | |
| 去：0001649 | 成骨细胞分化 | ISS | 10780858 | |
| 去：0001837 | 上皮到间质转变 | ISS | 10780858 | |
| 去：0009953 | 背/腹图形成 | 艾达 | 7666191 | |
| 去：0007605 | sensory perception of sound | IEA | - | |
| 去：0007389 | 模式规范过程 | IEA | - | |
| GO：0042060 | 伤口愈合 | ISS | 10780858 | |
| GO：0035019 | 体细胞维护 | 小鬼 | 17889703 | |
| GO：0042733 | 胚胎数字形态发生 | 小鬼 | 10080184 | |
| 去：0030514 | BMP信号通路的负调节 | IEA | - | |
| GO：0042474 | 中耳形态发生 | 小鬼 | 10080184 | |
| GO:0051216 | 软骨发展 | IEA | - | |
| GO:0045596 | 细胞分化的负调控 | IEA | - | |
| GO：0048570 | 脊索形态发生 | IEA | - | |
| GO：0048706 | 胚胎骨骼系统开发 | 小鬼 | 10080184 | |
| GO：0048646 | 解剖结构形成 | IEA | - | |
| GO：0060044 | 心肌细胞增殖的负调节 | ISS | 10780858 | |
| GO:0060173 | 肢体发展 | 小鬼 | 10080184 | |
| GO：0060272 | 胚胎骨骼关节形态发生 | 小鬼 | 16151340 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | pubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | EXP | 17029022 | |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 10080184 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-148/152 | 172 | 178 | M8 | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
| mir-181 | 192 | 198 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| MiR-200BC/429 | 247 | 254 | 1A，M8 | hsa-miR-200b | uaauacugccugguaaugaugac |
| hsa-miR-200c | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
| mir-329 | 204 | 210 | 1a | hsa-miR-329脑 | aacacaccugguaaccucuuu |
| mir-369-3p | 249 | 256 | 1A，M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
| miR-374 | 250 | 256 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |