概括
基因 92421
象征 CHMP4C
同义词 snf7-3 | shax3 | vps32c
描述 带电的多囊体蛋白4C
参考 MIM:610899|HGNC:HGNC:30599|ENSEMBL:ENSG00000164695|HPRD:18135|Vega:Otthumg00000164726
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q21.13
Pascal P值 0.922
胎儿β -0.512
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
CHMP4C CHR8 82665438 C t NM_152284 沉默的 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1507047 CHR16 50932778 CHMP4C 92421 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG内吞作用 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome膜贩运 129 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组内体分选复合物需要运输escrt 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP 265 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 137 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON 132 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn暂时TGFB1签名 109 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇4 112 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇7 118 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schmidt Por目标在肢体芽dn中 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因