基因页:CRLF1
概括?
基因 | 9244 |
象征 | CRLF1 |
同义词 | ciss | ciss1 | clf | clf-1 | nr6 | zcytor5 |
描述 | 细胞因子受体样因子1 |
参考 | MIM:604237|HGNC:HGNC:2364|ENSEMBL:ENSG00000006016|HPRD:09177|Vega:Otthumg00000183111 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p12 |
Pascal P值 | 0.113 |
Sherlock P值 | 0.248 |
胎儿β | -2.342 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00575127 | 19 | 18718742 | CRLF1 | 2.845e-4 | -0.334 | 0.039 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7842645 | CHR8 | 135093902 | CRLF1 | 9244 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CRLF1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ABCA3 | 0.90 | 0.91 |
标记4 | 0.89 | 0.90 |
SYT3 | 0.88 | 0.91 |
EVI5L | 0.86 | 0.88 |
LRFN1 | 0.86 | 0.89 |
megf8 | 0.86 | 0.87 |
C12orf68 | 0.85 | 0.88 |
Agrn | 0.85 | 0.88 |
AC024575.2 | 0.85 | 0.89 |
AP2A2 | 0.84 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.66 | -0.66 |
AF347015.31 | -0.66 | -0.66 |
AF347015.33 | -0.65 | -0.63 |
AC021016.1 | -0.65 | -0.68 |
AF347015.21 | -0.63 | -0.67 |
AP002478.3 | -0.63 | -0.67 |
COPZ2 | -0.62 | -0.64 |
FXYD1 | -0.62 | -0.60 |
mt-cyb | -0.62 | -0.62 |
higd1b | -0.62 | -0.64 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化Kras DN | 142 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标为B | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM上升 | 81 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
温曼对缺氧的适应 | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
温曼对缺氧DN的适应 | 41 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ingram SHH靶向DN | 64 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sato在胰腺癌中表观遗传沉默 | 49 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙齿龋齿DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN | 57 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Thum mir21靶向心脏病 | 17 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标 | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Poola侵入性乳腺癌DN | 134 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP | 87 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙血清敏感基因 | 90 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kohoutek CCNT2目标 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |