基因页：numbl

Summary？
基因ID 9253
象征 numbl
同义词 cag3a | ctg3a | nbl | numb-r | numblike | numbr | tnrc23
描述 麻木同源物（果蝇）类似
参考 MIM：604018|HGNC：HGNC：8061|ENSEMBL：ENSG00000105245|HPRD：04931|Vega：Otthumg00000182627
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.644
Sherlock P值 0.156
胎儿β -0.569
DMG 2（＃研究）
主持人 元
支持 结构可塑性
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 4
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.0329

部分即遗传学和epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG26933384 19 41188655 numbl 1.467E-4 0.434 0.031 DMG：Wockner_2014
cg13285447 19 41196734 numbl -0.02 0.33 DMG：Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TGIF2 0.91 0.60
TP53 0.91 0.75
CDK2 0.91 0.67
Gli3 0.90 0.52
MCM2 0.90 0.85
PTBP1 0.89 0.72
tead2 0.89 0.63
CELSR1 0.89 0.68
itprip 0.88 0.57
SFRP1 0.88 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.43 -0.71
HLA-F -0.42 -0.71
FBXO2 -0.42 -0.61
pth1r -0.42 -0.70
LHPP -0.41 -0.57
SLC16A11 -0.41 -0.65
asphd1 -0.41 -0.56
AIFM3 -0.40 -0.64
AF347015.27 -0.40 -0.76
AF347015.31 -0.40 -0.77

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IPI 16713569
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007409 轴突发生 IEA 神经元，轴突，神经突（GO期限：12） -
去：0007405 神经细胞增殖 IEA 神经元（GO期限：8） -
去：0030900 前脑发展 IEA 大脑（GO期限：8） -
去：0007399 神经系统发育 塔斯 神经突（GO期限：5） 9303539
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005737 cytoplasm IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Kegg Notch信号通路 47 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
刘普通癌基因 79 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WEI mir34a目标 148 97 All SZGR 2.0 genes in this pathway
狮子转移 539 324 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 All SZGR 2.0 genes in this pathway
陈代谢综合征网络 1210 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 626 632 1a HSA-LET-7A脑 ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B脑 ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C脑 ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D脑 AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
HSA-LET-7E脑 ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I脑 ugagguaguugugugugugcugu
mir-125/351 190 196 1a HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG
mir-142-3p 143 149 1a HSA-MIR-142-3P uguaguuuccuacuuuaugga
mir-203.1 221 227 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-218 448 454 1a HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-34/449 226 232 M8 HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-369-3p 741 748 1A，M8 HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
miR-374 742 748 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug