基因页：PDLIM7
概括？
| 基因 | 9260 |
| 象征 | PDLIM7 |
| 同义词 | LMP1 | LMP3 |
| 描述 | PDZ和LIM域7 |
| 参考 | MIM：605903|HGNC：HGNC：22958|ENSEMBL：ENSG00000196923|HPRD：10436|Vega：Otthumg00000130853 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q35.3 |
| Pascal P值 | 0.005 |
| Sherlock P值 | 0.659 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.0276 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0067 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1159612 | Chr10 | 85329057 | PDLIM7 | 9260 | 0.1 | 反式 | ||
| RS10879027 | CHR12 | 70237156 | PDLIM7 | 9260 | 0.01 | 反式 | ||
| RS6095741 | CHR20 | 48666589 | PDLIM7 | 9260 | 5.763E-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16713569 | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001503 | 骨化 | IEA | - | |
| 去：0006898 | 受体介导的内吞作用 | 塔斯 | 7929196 | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| 去：0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001725 | 压力纤维 | IEA | - | |
| 去：0001726 | 荷叶边 | IEA | - | |
| 去：0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BSG | 5f7 |CD147 |Emmprin |M6 |确定|TCSF | Basigin（OK血组） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| C16orf48 | DAKV6410 |DKFZP434A1319 | 染色体16开放阅读框48 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| C1orf65 | FLJ35728 |RP11-76K24.1 | 染色体1开放阅读框65 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| C20ORF195 | MGC5356 | 染色体20开放阅读框195 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| DKFZP761E198 | PP1030 | DKFZP761E198蛋白质 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| 宝石 | Kir |MGC26294 | GTP结合蛋白过表达骨骼肌 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| GFAP | FLJ45472 | 胶质原纤维酸性蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PAK7 | KIAA1264 |MGC26232 |PAK5 | P21蛋白（CDC42/RAC）激活激酶7 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| prkca | AAG6 |MGC129900 |MGC129901 |PKC-Alpha |PKCA |Prkaca | 蛋白激酶C，α | - | HPRD | 8940095 |
| Prkcb | MGC41878 |pkc-beta |PKCB |prkcb1 |PRKCB2 | 蛋白激酶C，β | - | HPRD | 8940095 |
| Prkcz | PKC-Zeta |PKC2 | 蛋白激酶C，Zeta | - | HPRD | 8940095 |
| PSMF1 | PI31 | 蛋白酶体（Prosome，大型）抑制剂亚基1（PI31） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| ret | CDHF12 |HSCR1 |men2a |men2b |mtc1 |PTC |ret-ele1 |RET51 | ret原癌基因 | - | HPRD，Biogrid | 12176011 |
| SPP1 | BNSP |BSPI |ETA-1 |MGC110940 |OPN | 分泌的磷蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| TPM2 | AMCD1 |DA1 |DA2B |TMSB | 肌球蛋白2（beta） | - | HPRD，Biogrid | 10359609 |
| ube2i | C358B7.1 |P18 |UBC9 | 泛素结合酶E2I（UBC9同源物，酵母） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| WWP2 | AIP2 |像WWP2一样 | 含有E3泛素蛋白连接酶2的WW结构域2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| ZNF165 | LD65 |ZSCAN7 | 锌指蛋白165 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID RET路径 | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wilcox对孕酮DN的反应 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basaki YBX1靶向 | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno岩石信号不是通过Rhoa DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥多内尔转移 | 82 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和血清剥夺DN的反应 | 84 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD UP | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX3 FOXO1融合的Ebauer肌原靶标 | 50 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 | 229 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Galindo对肠毒素的免疫反应 | 85 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lenaour树突状细胞成熟DN | 128 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染16小时DN | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伯顿成生成8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ambrosini Flavopiridol处理TP53 | 109 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Coulouarn暂时TGFB1签名 | 109 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应16 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bakker FOXO3靶向DN | 187 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |