基因页：MAPKAPK2

概括?
基因ID 9261
Symbol MAPKAPK2
同义词 MAPKAP-K2|MK-2|MK2
描述 mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 2
参考 MIM:602006|HGNC：HGNC：6887|Ensembl:ENSG00000162889|HPRD：11882|Vega：Otthumg0000000036342
基因type protein-coding
地图位置 1q32
Fetal beta 0.485
DMG 1（＃研究）
eGene 小脑半球

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Jaffe_2016 Genome-wide DNA methylation analysis 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统搜索PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0312

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg25748647 1 206858094 MAPKAPK2 2.48E-8 -0.038 8.02E-6 DMG:Jaffe_2016


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
strbp 0.90 0.93
CSDE1 0.90 0.93
STAU1 0.90 0.92
DHX29 0.90 0.92
LSG1 0.90 0.92
ZNF280D 0.90 0.93
kif2a 0.89 0.92
ZFP28 0.89 0.92
TERF2 0.89 0.92
ACTR8 0.89 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.78 -0.87
MT-CO2 -0.77 -0.86
ifi27 -0.75 -0.85
MT-CYB -0.75 -0.84
AF347015.27 -0.75 -0.84
FXYD1 -0.75 -0.85
AF347015.8 -0.74 -0.85
AF347015.33 -0.74 -0.82
higd1b -0.73 -0.84
HSD17B14 -0.73 -0.80

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0004871 signal transducer activity 塔斯 8179591
GO:0005515 protein binding 新闻学会 16278218|17255097|17292828
GO:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 塔斯 8280084
GO:0016740 transferase activity IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000165 MAPKKK级联 塔斯 8179591
GO:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 塔斯 8179591
去：0007265 Ras protein signal transduction EXP 11520933
去：0007242 intracellular signaling cascade EXP 9297626
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005829 cytosol EXP 8846784
GO:0005634 核 塔斯 8280084

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
AKT1 AKT | MGC99656 | PKB | PKB-ALPHA | PRKBA | RAC | RAC-ALPHA v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 1 - HPRD，Biogrid 11042204
ARPC5 ARC16 |MGC88523 |DJ127C7.3 |p16-arc actin related protein 2/3 complex, subunit 5, 16kDa MAPKAPK2与ARP2/3复合物的P16-ARC亚基相互作用并磷酸化 BIND 12829704
CDC25B - cell division cycle 25 homolog B (S. pombe) An unspecified isoform of MAPKAP kinase-2 interacts with and phosphorylates CDC25B. BIND 15629715
EGF homg4 |乌尔格 表皮生长因子（β-尿肿） Phenotypic Enhancement BioGRID 9687510
ETV1 DKFZP781L0674 |ER81 |MGC104699 |MGC120533 |MGC120534 ETS变体1 Biochemical Activity BioGRID 11551945
HNRNPA0 HNRPA0 异质核核糖核蛋白A0 MAPKAP-K2与HNRNPA0相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的MAPKAP-K2与人类HNRNPA0之间的相互作用进行建模的。 BIND 12456657
HSPB1 CMT2F | DKFZp586P1322 | HMN2B | HS.76067 | HSP27 | HSP28 | Hsp25 | SRP27 热休克27KDA蛋白1 - HPRD，Biogrid 11042204
HSPB1 CMT2F | DKFZp586P1322 | HMN2B | HS.76067 | HSP27 | HSP28 | Hsp25 | SRP27 热休克27KDA蛋白1 MK2 phosphorylates Hsp27. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human MK2 and Hsp27 from an unspecified species. BIND 15692053
MAPK1 ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk mitogen-activated protein kinase 1 Affinity Capture-Western BioGRID 15094067
MAPK14 CSBP1 | CSBP2 | CSPB1 | EXIP | Mxi2 | PRKM14 | PRKM15 | RK | SAPK2A | p38 | p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 - HPRD，Biogrid 9768359|11042204
|11551945
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物（小鼠） MDM2 (HDM2) interacts with MAPKAPK2 isoform 1 (MK2). This interaction was modeled on a demonstrated interaction between MDM2 from an unspecified species, and human MAPKAPK2. BIND 15688025
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物（小鼠） MDM2 (HDM2) interacts with MAPKAPK2 (MK2) isoform 2. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between MDM2 from an unspecified species, and human MAPKAPK2. BIND 15688025
PHC2 EDR2 | HPH2 | MGC163502 | PH2 多瘤同源物2（果蝇） - HPRD，Biogrid 15094067
SHC1 FLJ26504 |SHC |SHCA SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1 - HPRD，Biogrid 15094067
TCF3 e2a |itf1 |MGC129647 |MGC129648 |BHLHB21 transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47) - HPRD，Biogrid 10781029
ywhaz KCIP-1 | MGC111427 | MGC126532 | MGC138156 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，Zeta多肽 MAPKAPK2与14-3-3-zeta相互作用并磷酸化。 BIND 12861023


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg vegf信号通路 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MAPK途径 87 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA P38MAPK PATHWAY 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA HSP27 PATHWAY 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST P38 MAPK途径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 1 Pathway 55 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P38 MK2 PATHWAY 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID p38 alpha beta下游途径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGFR1 2途径 69 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MAPK TRK途径 34 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 74 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome对RAS的信号传导 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALLING TO ERKS 36 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P38MAPK事件 13 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NUCLEAR EVENTS KINASE AND TRANSCRIPTION FACTOR ACTIVATION 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF MRNA 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MAP KINASE ACTIVATION IN TLR CASCADE 50 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MAPK靶向由MAP激酶介导的核事件 30 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TA​​K1介导P38 MAPK激活 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRF1对mRNA的反应组不稳定 17 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRAF6 MEDIATED INDUCTION OF NFKB AND MAP KINASES UPON TLR7 8 OR 9 ACTIVATION 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DESTABILIZATION OF MRNA BY TRISTETRAPROLIN TTP 17 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MYD88 MAL CASCADE INITIATED ON PLASMA MEMBRANE 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INNATE IMMUNE SYSTEM 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATED TLR4 SIGNALLING 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TOLL RECEPTOR CASCADES 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU VMYB TARGETS UP 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU TARGETS OF VMYB VS CMYB DN 43 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FALVELLA SMOKERS WITH LUNG CANCER 80 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN METASTASIS DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NIKOLSKY BREAST CANCER 1Q32 AMPLICON 13 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bystroem与IL5 DN相关 64 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌电纤维酸DN 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc TGFA DN 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC E2F1 DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
brocke凋亡由IL6逆转 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc DN 63 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER E2F1 DN 64 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NEMETH INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LENAOUR DENDRITIC CELL MATURATION DN 128 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VARELA ZMPSTE24 TARGETS UP 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制肌肉DN 51 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS UP 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tsuda肺泡软零件肉瘤 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GU PDEF目标 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 17 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONGUSAHA BRCA1 TARGETS DN 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-137 32 39 1A,m8 hsa-miR-137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
mir-485-3p 1524年 1530 m8 HSA-MIR-485-3P GUCAUACACGGCUCUCCUCUCU
miR-9 1197 1204 1A,m8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga