概括
基因 9266
象征 Cyth2
同义词 arno | cts18 | cts18.1 | pscd2 | pscd2l | sec7l | sec7p-l | sec7p类似
描述 细胞嵌素2
参考 MIM:602488|HGNC:HGNC:9502|ENSEMBL:ENSG00000105443|HPRD:03925|Vega:Otthumg00000150245
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.33
Pascal P值 0.454
Sherlock P值 0.848
胎儿β 0.866
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0089

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24083067 19 48972665 Cyth2 7.94e-5 -0.54 0.025 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
npy1r 0.74 0.59
C1orf62 0.72 0.59
LMO4 0.72 0.55
TAL2 0.68 0.57
npnt 0.66 0.52
rasgef1c 0.65 0.66
RPRM 0.65 0.63
PTX3 0.64 0.57
STK32B 0.63 0.54
PPP1R14C 0.63 0.61
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
REEP6 -0.43 -0.42
TSC22D4 -0.39 -0.42
AIFM3 -0.39 -0.42
AF347015.27 -0.39 -0.49
HLA-F -0.39 -0.39
RHBDL3 -0.39 -0.47
hepn1 -0.38 -0.41
Renbp -0.38 -0.43
克鲁 -0.38 -0.39
AF347015.33 -0.38 -0.49

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005086 ARF鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
去:0005086 ARF鸟苷核苷酸交换因子活性 塔斯 9417041
去:0005515 蛋白质结合 IPI 14654833|16415858
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006897 内吞作用 塔斯 9417041
去:0030036 肌动蛋白细胞骨架组织 塔斯 9417041
GO:0032012 调节ARF蛋白信号转导 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005624 膜分数 塔斯 9417041
去:0005886 质膜 塔斯 9417041

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta ARAP途径 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6途径 35 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3KCI途径 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF 3 Pathway 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔卡拉凋亡 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petretto血压DN 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线响应6小时 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C2的反应 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1的早期反应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线响应1小时DN 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang击倒第二个EGF脉冲 293 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-28 114 120 M8 HSA-MIR-28 Aaggagcucacagucuauugag