基因页面:WDR46
总结吗?
| GeneID | 9277年 |
| 象征 | WDR46 |
| 同义词 | 得| C6orf11 | FP221 | UTP7 |
| 描述 | WD重复域46 |
| 参考 | MIM: 611440|HGNC: HGNC: 13923|运用:ENSG00000227057|HPRD: 12839|织女:OTTHUMG00000031192 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 . 3 |
| 帕斯卡假定值 | 1.795 e-5 |
| 胎儿β | -0.166 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg20037999 | 6 | 33256950 | WDR46 | 1.53 e-9 | -0.015 | 1.43 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2621382 | chr6 | 32760444 | WDR46 | 9277年 | 0.04 | 独联体 | ||
| rs10519210 | chr15 | 63737924 | WDR46 | 9277年 | 0.02 | 反式 | ||
| snp_a - 1819805 | 0 | WDR46 | 9277年 | 0.03 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PHKG1 | 0.81 | 0.84 |
| SLC12A4 | 0.81 | 0.82 |
| PBXIP1 | 0.81 | 0.87 |
| PPAP2B | 0.80 | 0.79 |
| LRP10 | 0.80 | 0.84 |
| EPHX2 | 0.79 | 0.84 |
| RFX4 | 0.79 | 0.83 |
| PIPOX | 0.79 | 0.84 |
| ITGB4 | 0.79 | 0.78 |
| A2ML1 | 0.78 | 0.83 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C1orf96 | -0.53 | -0.62 |
| FAM49A | -0.52 | -0.61 |
| GPR21 | -0.52 | -0.68 |
| MYT1L | -0.52 | -0.59 |
| KHDRBS3 | -0.51 | -0.64 |
| ARL4D | -0.51 | -0.58 |
| SRPK1 | -0.51 | -0.61 |
| TOMM20 | -0.51 | -0.61 |
| LDB2 | -0.51 | -0.55 |
| NELL2 | -0.50 | -0.61 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003824 | 催化活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004812 | 氨酰连接酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030170 | 磷酸吡哆醛绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006418 | tRNA氨酰化蛋白质翻译 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008150 | biological_process | ND | - - - - - - | |
| 去:0009058 | 生物合成的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005575 | cellular_component | ND | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘CMYB目标了 | 165年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘VMYB目标了 | 127年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOHANKUMAR TLX1目标了 | 414年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ROZANOV MMP14目标了 | 266年 | 171年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 谢泼德粉碎和燃烧突变 | 197年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RODWELL肾脏老化了 | 487年 | 303年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN | 911年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN | 1011年 | 592年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 | 393年 | 244年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOCHKIS FOXA2目标 | 425年 | 261年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张及目标60 hr DN | 277年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝母细胞癌类了 | 605年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DUTERTRE雌二醇反应6小时 | 229年 | 149年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不通过AKT1 BHAT ESR1目标 | 211年 | 131年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过AKT1 BHAT ESR1目标 | 281年 | 183年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李BMP2 DN的目标 | 882年 | 538年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PURBEY CTBP1和SATB1 DN的目标 | 180年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |