基因页面:SHKBP1
总结吗?
| GeneID | 92799年 |
| 象征 | SHKBP1 |
| 同义词 | PP203 | Sb1 |
| 描述 | SH3KBP1结合蛋白1 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 19214|运用:ENSG00000160410|HPRD: 15338|织女:OTTHUMG00000182602 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 19 q13.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.38 |
| 这样假定值 | 0.016 |
| 胎儿β | -0.508 |
| DMG | 1(#研究) |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SHKBP1 | chr19 | 41096218 | C | G | NM_138392 | p.553S > C | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg12187069 | 19 | 41082589 | SHKBP1 | 1.36 e-6 | -0.455 | 0.007 | DMG: Wockner_2014 |
| cg07989796 | 19 | 41082579 | SHKBP1 | 3.58 e-5 | -0.318 | 0.02 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 加里CD5目标了 | 473年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VECCHI胃癌早期 | 430年 | 232年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 帕蒂尔肝癌 | 747年 | 453年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 廖转移 | 539年 | 324年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1 DN的目标 | 314年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过C组TP53棕熊短波紫外线反应 | 92年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KASLER HDAC7目标1 | 194年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |