概括
基因 9320
象征 Trip12
同义词 Trip-12 | Ulf
描述 甲状腺激素受体相互作用12
参考 MIM:604506|HGNC:HGNC:12306|ENSEMBL:ENSG00000153827|HPRD:05144|Vega:Otthumg00000153623
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q36.3
Pascal P值 0.041
Sherlock P值 0.956
胎儿β -0.438
DMG 1(#研究)
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21333026 2 230715536 Trip12 7.12e-5 0.245 0.025 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RGS5 0.79 0.88
Col14a1 0.77 0.79
myh11 0.77 0.85
MSRB3 0.75 0.76
LMOD1 0.73 0.81
GBP2 0.72 0.85
IL1R1 0.71 0.79
JPH2 0.70 0.75
FAM129A 0.70 0.67
斯托姆 0.70 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
nkiras2 -0.56 -0.66
ZNF821 -0.56 -0.69
KIAA1949 -0.56 -0.65
ZNF311 -0.55 -0.70
HN1 -0.55 -0.67
mpp3 -0.55 -0.67
tubb2b -0.55 -0.66
DBN1 -0.55 -0.67
PODXL2 -0.55 -0.67
CCDC123 -0.55 -0.66

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG泛素介导的蛋白水解 138 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合目标B DN 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 87 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nguyen Notch1靶向DN 86 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戴尔基癌俯卧反应BPA 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌DN 80 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因