基因页：HMGN3
概括？
| 基因 | 9324 |
| 象征 | HMGN3 |
| 同义词 | PNAS-24 | PNAS-25 | TRIP7 |
| 描述 | 高迁移率组核小体结合结构域3 |
| 参考 | MIM：604502|HGNC：HGNC：12312|ENSEMBL：ENSG00000118418|HPRD：16062|Vega：Otthumg0000000015073 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6Q14.1 |
| Pascal P值 | 0.353 |
| Sherlock P值 | 0.754 |
| 胎儿β | 1.013 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08621418 | 6 | 79944414 | HMGN3 | 9.14e-5 | -0.357 | 0.027 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| GO：0046966 | 甲状腺激素受体结合 | nas | 7776974 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008150 | 生物_Process | nd | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0000785 | 染色质 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | nas | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 威尔科克斯对孕酮的反应 | 152 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP | 117 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dacosta ercc3等位基因XPCS vs TTD DN | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer Sox9在前列腺开发中的目标 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard粉碎和燃烧突变体DN | 185 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lenaour树突状细胞成熟 | 114 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NPM1定位DN的Alcalay AML | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 | 163 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bild HRAS致癌特征 | 261 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| coates巨噬细胞M1 vs M2向上 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G5 DN | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝脏开发 | 166 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hirsch细胞转化特征dn | 103 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组C的UVC响应 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-137 | 325 | 331 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
| mir-214 | 395 | 402 | 1A，M8 | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
| mir-29 | 337 | 343 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||