基因页面:远方
总结吗?
GeneID | 9325年 |
象征 | 远方 |
同义词 | ASC-1 | ASC1 | HsT17391 | ZC2HC5 |
描述 | 甲状腺激素受体关联4 |
参考 | MIM: 604501|HGNC: HGNC: 12310|运用:ENSG00000103671|HPRD: 05140|织女:OTTHUMG00000133033 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 15 q22.31 |
帕斯卡假定值 | 0.003 |
胎儿β | 1.05 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 下丘脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg19329389 | 15 | 64680051 | 远方 | -0.028 | 0.41 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10497672 | 0 | 远方 | 9325年 | 0.08 | 反式 | |||
rs16894557 | chr6 | 28999825 | 远方 | 9325年 | 0.06 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRIP4_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NKAIN2 | 0.85 | 0.77 |
TAL2 | 0.84 | 0.77 |
DAAM1 | 0.83 | 0.89 |
L3MBTL3 | 0.83 | 0.89 |
STMN2 | 0.81 | 0.88 |
SLC44A5 | 0.81 | 0.90 |
NT5C3 | 0.81 | 0.88 |
NOL4 | 0.81 | 0.87 |
HMGCR | 0.81 | 0.88 |
KLF6 | 0.80 | 0.88 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.61 | -0.78 |
TSC22D4 | -0.60 | -0.79 |
AIFM3 | -0.58 | -0.70 |
HEPN1 | -0.57 | -0.71 |
S100B | -0.57 | -0.76 |
TREX1 | -0.57 | -0.76 |
俱乐部 | -0.56 | -0.66 |
PAQR6 | -0.56 | -0.82 |
MT-CO2 | -0.56 | -0.80 |
HSD17B14 | -0.56 | -0.72 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ASCC2 | ASC1p100 | 激活信号cointegrator 1复杂单元2 | - - - - - - | HPRD | 12077347 |
ASCC3 | ASC1p200 | DJ467N11.1 | HELIC1 | MGC26074 | RNAH | dJ121G13.4 | 激活信号cointegrator 1复杂的亚基3 | - - - - - - | HPRD | 12077347 |
CREBBP | 海关与边境保护局| KAT3A | rst | 结合蛋白分子 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10454579 |
EP300 | KAT3B | p300 | E1A结合蛋白p300 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10454579 |
ESR1 | ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 | 雌激素受体1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10454579 |
GTF2A1 | MGC129969 | MGC129970 | TF2A1 | TFIIA | 通用转录因子活动花絮,1,19/37kDa | - - - - - - | HPRD | 10454579 |
小君 | AP-1 | AP1 | c-Jun | 小君致癌基因 | - - - - - - | HPRD | 12077347 |
NCOA1 | F-SRC-1 | KAT13A | MGC129719 | MGC129720 | NCoA-1 | RIP160 | SRC-1 | SRC1 | bHLHe42 | 核受体共激活剂1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10454579 |
NFKB1 | DKFZp686C01211 | EBP-1 | KBF1 | MGC54151 | NF-kappa-B | NFKB-p105 | NFKB-p50 |施敏原著 | 核因子k光多肽基因增强剂b细胞1 | - - - - - - | HPRD | 12077347 |
RARA | NR1B1 | RAR | 视黄酸受体α | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10454579 |
RELA | MGC131774 | NFKB3 | p65 | v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | - - - - - - | HPRD | 12077347 |
RXRA | FLJ00280 | FLJ00318 | FLJ16020 | FLJ16733 | MGC102720 | NR2B1 | 类维生素a X受体α | - - - - - - | HPRD | 7776974 |
梅毒性心脏病 | - - - - - - | Src同源性2 D域包含改变蛋白质 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10454579 |
SRC | c - src ASV | SRC1 | | p60-Src | v - src肉瘤(Schmidt-Ruppin a)病毒致癌基因相同器官(禽流感) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 10454579 |
真沸点 | GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID | TATA盒结合蛋白 | - - - - - - | HPRD | 10454579 |
THRB | ERBA-BETA | ERBA2 | GRTH | MGC126109 | MGC126110 | NR1A2 | PRTH | THR1 | THRB1 | THRB2 | 甲状腺激素受体β(erythroblastic白血病病毒(v-erb-a)致癌基因同族体2,鸟类) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7776974|10454579 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
GRAESSMANN血清剥夺了细胞凋亡 | 552年 | 347年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH OCT4目标 | 290年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯应对TRABECTEDIN DN | 271年 | 175年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 | 720年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森受E2F4如果 | 728年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过甲基化NOUSHMEHR GBM沉默 | 50 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARTENS受PML RARA融合 | 456年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PILON KLF1目标了 | 504年 | 321年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |