概括
基因 9326
象征 Znhit3
同义词 Trip3
描述 锌指命中型包含3个
参考 MIM:604500|HGNC:HGNC:12309|ENSEMBL:ENSG00000273611|HPRD:05139|Vega:Otthumg00000188436
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q12
Pascal P值 3.793E-4
Sherlock P值 0.65
胎儿β 0.344
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25975805 17 34838641 Znhit3 4.48e-8 -0.013 1.23e-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
gnaz 0.87 0.89
PACS1 0.87 0.90
PIK3R2 0.86 0.90
SNX26 0.85 0.88
Gprin1 0.84 0.88
KCTD13 0.84 0.88
TNRC4 0.84 0.88
mast1 0.84 0.86
MAPKBP1 0.84 0.89
PCDHGC4 0.84 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.67 -0.78
AF347015.27 -0.67 -0.78
MT-CO2 -0.66 -0.79
mt-cyb -0.65 -0.76
AF347015.33 -0.64 -0.74
AF347015.8 -0.64 -0.77
S100B -0.63 -0.72
AF347015.15 -0.62 -0.74
C5orf53 -0.61 -0.65
AF347015.2 -0.61 -0.76

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 177 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT网络 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA中心网络 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍尔曼天冬酰胺酶抗性所有DN 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因