基因页:Znhit3
概括?
基因 | 9326 |
象征 | Znhit3 |
同义词 | Trip3 |
描述 | 锌指命中型包含3个 |
参考 | MIM:604500|HGNC:HGNC:12309|ENSEMBL:ENSG00000273611|HPRD:05139|Vega:Otthumg00000188436 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q12 |
Pascal P值 | 3.793E-4 |
Sherlock P值 | 0.65 |
胎儿β | 0.344 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25975805 | 17 | 34838641 | Znhit3 | 4.48e-8 | -0.013 | 1.23e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNHIT3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
gnaz | 0.87 | 0.89 |
PACS1 | 0.87 | 0.90 |
PIK3R2 | 0.86 | 0.90 |
SNX26 | 0.85 | 0.88 |
Gprin1 | 0.84 | 0.88 |
KCTD13 | 0.84 | 0.88 |
TNRC4 | 0.84 | 0.88 |
mast1 | 0.84 | 0.86 |
MAPKBP1 | 0.84 | 0.89 |
PCDHGC4 | 0.84 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.78 |
AF347015.27 | -0.67 | -0.78 |
MT-CO2 | -0.66 | -0.79 |
mt-cyb | -0.65 | -0.76 |
AF347015.33 | -0.64 | -0.74 |
AF347015.8 | -0.64 | -0.77 |
S100B | -0.63 | -0.72 |
AF347015.15 | -0.62 | -0.74 |
C5orf53 | -0.61 | -0.65 |
AF347015.2 | -0.61 | -0.76 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA XPRSS INT网络 | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA中心网络 | 117 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍尔曼天冬酰胺酶抗性所有DN | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |