概括
基因 9329
象征 GTF3C4
同义词 kat12 | tf3c-delta | tfiii90 | tfiiic290 | tfiiic90 | tfiiicdelta
描述 一般转录因子IIIC亚基4
参考 MIM:604892|HGNC:HGNC:4667|HPRD:11998|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9Q34.13
Pascal P值 0.333
胎儿β 0.71
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9571716 CHR13 67711344 GTF3C4 9329 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Notch1 0.90 0.81
FBXL7 0.85 0.80
sall1 0.84 0.76
sall3 0.83 0.75
LTBP1 0.83 0.67
pard3b 0.83 0.75
Sox9 0.83 0.68
jag1 0.82 0.68
flnc 0.81 0.68
SOX2 0.81 0.63
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Fabp3 -0.27 -0.31
Sycp3 -0.26 -0.40
ZFAND2A -0.26 -0.41
Rergl -0.26 -0.31
TTC9B -0.25 -0.43
NPM2 -0.25 -0.23
CAMK1 -0.24 -0.26
USMG5 -0.24 -0.46
PPEF1 -0.24 -0.32
Sergef -0.24 -0.26

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
2型启动子的Reactome RNA Pol III转录启动 23 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol III转录 33 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化APOBEC2 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jazag tgfb1发出信号 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA受伽马辐射损伤 81 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由Kras Pten Up 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期M G1 148 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因