基因页:GTF3C4
概括?
基因 | 9329 |
象征 | GTF3C4 |
同义词 | kat12 | tf3c-delta | tfiii90 | tfiiic290 | tfiiic90 | tfiiicdelta |
描述 | 一般转录因子IIIC亚基4 |
参考 | MIM:604892|HGNC:HGNC:4667|HPRD:11998| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q34.13 |
Pascal P值 | 0.333 |
胎儿β | 0.71 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9571716 | CHR13 | 67711344 | GTF3C4 | 9329 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GTF3C4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Notch1 | 0.90 | 0.81 |
FBXL7 | 0.85 | 0.80 |
sall1 | 0.84 | 0.76 |
sall3 | 0.83 | 0.75 |
LTBP1 | 0.83 | 0.67 |
pard3b | 0.83 | 0.75 |
Sox9 | 0.83 | 0.68 |
jag1 | 0.82 | 0.68 |
flnc | 0.81 | 0.68 |
SOX2 | 0.81 | 0.63 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Fabp3 | -0.27 | -0.31 |
Sycp3 | -0.26 | -0.40 |
ZFAND2A | -0.26 | -0.41 |
Rergl | -0.26 | -0.31 |
TTC9B | -0.25 | -0.43 |
NPM2 | -0.25 | -0.23 |
CAMK1 | -0.24 | -0.26 |
USMG5 | -0.24 | -0.46 |
PPEF1 | -0.24 | -0.32 |
Sergef | -0.24 | -0.26 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
2型启动子的Reactome RNA Pol III转录启动 | 23 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol III转录 | 33 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化APOBEC2 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA受伽马辐射损伤 | 81 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由Kras Pten Up | 181 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |