基因页：CD163

概括？
基因 9332
象征 CD163
同义词 M130 | MM130
描述 CD163分子
参考 MIM：605545|HGNC：HGNC：1631|ENSEMBL：ENSG00000177575|HPRD：05708|Vega：Otthumg00000168353
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12p13.3
Pascal P值 0.352
胎儿β -1.655
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.7856

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
CD163 CHR12 7647737 t C NM_004244
NM_203416		 p.454n> d
p.454n> d		 错过
错过		 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17775722 Chr9 26199256 CD163 9332 0.07 反式
RS2948491 Chrx 40180688 CD163 9332 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DZIP3 0.88 0.91
FAM102B 0.88 0.92
SCN2A 0.88 0.90
cltc 0.87 0.88
FBXL17 0.87 0.87
Col4a3bp 0.87 0.86
PNMA2 0.87 0.86
ARMCX3 0.87 0.87
ywhab 0.87 0.86
EPS15 0.86 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
EIF4EBP3 -0.54 -0.56
AF347015.21 -0.54 -0.45
FXYD1 -0.51 -0.44
Rab34 -0.51 -0.56
ACSF2 -0.50 -0.49
增强 -0.50 -0.51
C1orf61 -0.50 -0.57
C1orf54 -0.50 -0.50
higd1b -0.50 -0.46
PLA2G5 -0.50 -0.42

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005044 清道夫受体活性 nas 8370408
去：0005515 蛋白质结合 IPI 15479433
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006954 炎症反应 IEA -
去：0006953 急性期反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 nas -
去：0005886 质膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 塔斯 8370408

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9融合3D DN的Takeda目标 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
帕帕斯帕斯帕贝多诺斯不稳定的动脉粥样硬化斑块 52 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mattioli mgus vs多发性骨髓瘤 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN 81 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up 87 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lenaour树突状细胞成熟DN 128 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
appel imatinib响应 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Gist和滑膜肉瘤DN 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen lvad支持失败的心 103 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向 93 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hecker IFNB1目标 95 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-181 174 180 M8 HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-23 176 182 M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-323 176 182 1a HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu