基因页:myl10
概括?
基因 | 93408 |
象征 | myl10 |
同义词 | mylc2pl | plrlc |
描述 | 肌球蛋白轻链10 |
参考 | HGNC:HGNC:29825|ENSEMBL:ENSG00000106436|HPRD:17620|Vega:Otthumg00000157137 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q22.1 |
Pascal P值 | 0.02 |
胎儿β | -0.147 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG16581017 | 7 | 101256647 | myl10 | 3.58e-5 | -0.532 | 0.02 | DMG:Wockner_2014 |
CG23004960 | 7 | 101268430 | myl10 | 1.999E-4 | -0.341 | 0.035 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MYL10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg白细胞跨内皮迁移 | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 | 128 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM胃癌化学敏感性 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng IL22信号传导DN | 42 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huang Gata2靶向 | 149 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |