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总结吗?

GeneID	9342年
象征	SNAP29
同义词	CEDNIK \| SNAP-29
描述	突触体相关蛋白29 kda
参考	MIM: 604202\|HGNC: HGNC: 11133\|运用:ENSG00000099940\|HPRD: 11968\|织女:OTTHUMG00000150765
基因型	蛋白质编码
地图上的位置	22 q11.21
帕斯卡假定值	0.23
夏洛克假定值	0.271
胎儿β	-0.705
eGene	尾状基底神经节小脑半球小脑皮质额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节硬膜基底神经节元
支持	胞外分泌

基因数据来源

基因集名称	基因的方法设置	描述	信息
CNV:是的	拷贝数变异的研究	人工管理
简历:GWASdb	全基因组关联研究	精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp	全基因组关联研究	GWAS
PMID: cooccur	高通量文献检索	系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
协会	综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究	2	链接到SZGene
GSMA_I	基因组扫描分析	Psr: 0.031
文学	高通量文献检索	与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经	点击显示详细信息
GO_Annotation	neuro-related关键字映射到基因本体论注释	支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

eQTL注释

SNP ID	染色体	位置	eGene	基因Entrez ID	pvalue	TSS距离	eQTL类型
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。	22	21102197	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.359 e-8	-111574年	gtex_brain_putamen_basal
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rs73162876	22	21273196	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.364 e-8	59425年	gtex_brain_putamen_basal
rs5752261	22	21275053	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.364 e-8	61282年	gtex_brain_putamen_basal
rs73162881	22	21278298	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.395 e-8	64527年	gtex_brain_putamen_basal
rs113257264	22	21281426	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.364 e-8	67655年	gtex_brain_putamen_basal
rs200567800	22	21286943	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.123 e -	73172年	gtex_brain_putamen_basal
rs1978098	22	21288871	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.364 e-8	75100年	gtex_brain_putamen_basal
rs5761429	22	21293653	SNAP29	ENSG00000099940.7	6.918 e-9	79882年	gtex_brain_putamen_basal
rs5761433	22	21294414	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.364 e-8	80643年	gtex_brain_putamen_basal
rs5761460	22	21297251	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.118 e -	83480年	gtex_brain_putamen_basal
rs5761464	22	21298018	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.123 e -	84247年	gtex_brain_putamen_basal
rs367989811	22	21298692	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.364 e-8	84921年	gtex_brain_putamen_basal
rs2023715	22	21300844	SNAP29	ENSG00000099940.7	2.426 e-8	87073年	gtex_brain_putamen_basal
rs5761520	22	21312889	SNAP29	ENSG00000099940.7	1.782 e-8	99118年	gtex_brain_putamen_basal
rs144554847	22	21313072	SNAP29	ENSG00000099940.7	2.066 e-8	99301年	gtex_brain_putamen_basal

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因	皮尔森的相关性	斯皮尔曼的相关性
MRPL21	0.86	0.82
MRPL22	0.84	0.77
SUCLG1	0.84	0.83
HBXIP	0.84	0.80
NDUFA12	0.83	0.83
PSMA6	0.82	0.79
ATP5O	0.82	0.84
HAX1	0.82	0.79
RBX1	0.82	0.82
GTF3A	0.81	0.76

十大负面中的基因
基因	皮尔森的相关性	斯皮尔曼的相关性
MYH9	-0.50	-0.49
TENC1	-0.47	-0.55
SEMA3G	-0.47	-0.51
PEAR1	-0.46	-0.51
DOCK6	-0.46	-0.52
FAM38A	-0.45	-0.53
MMRN2	-0.45	-0.46
MTSS1L	-0.45	-0.49
英格	-0.45	-0.49
GPR124	-0.44	-0.49

第三部分。基因本体论注释

分子功能	去的术语	证据	神经的关键词	PubMed ID
去:0005484	提前受体活动	助教		10839363
生物过程	去的术语	证据	神经的关键词	PubMed ID
去:0006944	膜融合	助教		10839363
去:0006903	囊泡的目标	助教		9852078
去:0006887	胞外分泌	助教		10839363
去:0015031	蛋白质的运输	国际能源机构		- - - - - -
蜂窝组件	去的术语	证据	神经的关键词	PubMed ID
去:0019717	突触体	国际能源机构	Synap,大脑(术语层面:7)	- - - - - -
去:0045202	突触	国际能源机构	Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2)	- - - - - -
去:0005737	细胞质	国际能源机构		- - - - - -
去:0005886	等离子体膜	助教		9852078
去:0030054	细胞结	国际能源机构		- - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员	别名B	官方全名B	实验	源	PubMed ID
AP2A1	ADTAA \| AP2-ALPHA \| CLAPA1	adaptor-related蛋白复合物2,α1亚基	- - - - - -	HPRD	11423532
C1orf190	FLJ25163	染色体1 190年开放阅读框	2台混合动力	BioGRID	16189514
CD7	GP40 \| LEU-9 \| TP41 \| Tp40	CD7分子	- - - - - -	HPRD	9852078\|11423532
EHD1	过去FLJ42622 \| FLJ44618 \| H-PAST \| HPAST1 \| \| PAST1	EH-domain包含1	EHD1与SNAP29交互。	绑定	11423532
EHD1	过去FLJ42622 \| FLJ44618 \| H-PAST \| HPAST1 \| \| PAST1	EH-domain包含1	- - - - - -	HPRD, BioGRID	11423532
EHD3	PAST3	EH-domain包含3	EHD3与SNAP29交互。这种交互是仿照人类SNAP29演示鼠标EHD3和之间的相互作用。	绑定	11423532
EHD3	PAST3	EH-domain包含3	2台混合动力	BioGRID	11423532
ESR1	ER DKFZp686N23123 \| \| ESR \|将有关\| \|时代NR3A1	雌激素受体1	ER与SNAP29交互。	绑定	16009131
IGF1R	CD221 \| IGFIR \| JTK13 \| MGC142170 \| MGC142172 \| MGC18216	胰岛素样生长因子1受体	- - - - - -	HPRD, BioGRID	11423532
SNAP29	CEDNIK \| FLJ21051 \| SNAP-29	synaptosomal-associated蛋白质,29 kda	SNAP29 homodimerzes。	绑定	11423532
SNAP29	CEDNIK \| FLJ21051 \| SNAP-29	synaptosomal-associated蛋白质,29 kda	2台混合动力	BioGRID	11423532
STX12	MGC51957 \| STX13 \| STX14	突触融合蛋白12	- - - - - -	HPRD, BioGRID	9852078
STX17	FLJ20651 \| MGC102796 \| MGC126613 \| MGC126615	突触融合蛋白17	- - - - - -	HPRD, BioGRID	9852078
STX1A	HPC-1 \| STX1 \| p35-1	突触融合蛋白1(大脑)	- - - - - -	HPRD, BioGRID	9852078
STX3	STX3A	突触融合蛋白3	- - - - - -	HPRD, BioGRID	9852078
STX4	STX4A \| p35-2	突触融合蛋白4	重新组成复杂	BioGRID	9852078
STX6	- - - - - -	突触融合蛋白6	- - - - - -	HPRD	9880331\|11423532
STX7	- - - - - -	突触融合蛋白7	- - - - - -	HPRD, BioGRID	9852078\|11423532
VAMP7	SYBL1 \| TI-VAMP \| VAMP-7	vesicle-associated膜蛋白7	- - - - - -	HPRD, BioGRID	12853575

部分诉通路注释

路径名称	通道尺寸	# SZGR 2.0基因通路	信息
膜泡运输KEGG网罗交互	38	25	所有SZGR 2.0基因通路
DN GOZGIT ESR1目标	781年	465年	所有SZGR 2.0基因通路
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲	479年	299年	所有SZGR 2.0基因通路
洛克伍德在肺癌放大	214年	139年	所有SZGR 2.0基因通路
丁肺癌拷贝数的表达式	One hundred.	62年	所有SZGR 2.0基因通路
MASSARWEH他莫昔芬耐了	578年	341年	所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织	863年	514年	所有SZGR 2.0基因通路
BONOME卵巢癌生存最佳减积	246年	152年	所有SZGR 2.0基因通路
约翰斯通PARVB目标2	140年	94年	所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应迟	1137年	655年	所有SZGR 2.0基因通路
DN PEDRIOLI MIR31目标	418年	245年	所有SZGR 2.0基因通路
LIM乳腺干细胞DN	428年	246年	所有SZGR 2.0基因通路

基因页面:SNAP29