基因页：eftud2
概括？
| 基因 | 9343 |
| 象征 | eftud2 |
| 同义词 | MFDGA | MFDM | SNRNP116 | SNRP116 | SNU114 | U5-116KD |
| 描述 | 伸长因子TU GTP结合结构域包含2 |
| 参考 | MIM：603892|HGNC：HGNC：30858|ENSEMBL：ENSG00000108883|HPRD：04869|Vega：Otthumg00000179865 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q21.31 |
| Pascal P值 | 0.251 |
| 胎儿β | -0.121 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| eftud2 | CHR17 | 42942362 | C | G | NM_001142605 NM_001258353 NM_001258354 NM_004247 |
p.372e> d p.407e> d p.397e> d p.407e> d |
错过 错过 错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG20902737 | 17 | 42976442 | eftud2 | 1.65e-8 | -0.022 | 6.06E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | eftud2 | 9343 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ARPC3 | ARC21 |p21-arc | 肌动蛋白相关蛋白2/3复合物，亚基3，21KDA | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| CD2BP2 | FWP010 |lin1 |SNU40 |U5-52K | CD2（细胞质尾巴）结合蛋白2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| GSTK1 | GST13 | 谷胱甘肽S-转移酶Kappa 1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| 我的C | Bhlhe39 |c-myc | V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物（禽类） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| phlda3 | tih1 | PLECKSTRIN同源域，家庭A，成员3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PRPF6 | ant-1 |C20orf14 |汤姆|U5-102K |HPRP6 | PRP6前MRNA处理因子6同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD | 10788320 |
| PRPF8 | HPRP8 |prp8 |PRPC8 |RP13 | PRP8前MRNA处理因子8同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD，Biogrid | 9774689 |
| RNPS1 | E5.1 |MGC117332 | RNA结合蛋白S1，富含丝氨酸的结构域 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| RNU11 | U11 | RNA，U11小核 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15146077 |
| RNU12 | U12 | RNA，U12小核 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15146077 |
| SFRS12 | DKFZP564B176 |MGC133045 |SRRP508 |SRRP86 | 剪接因子，精氨酸/丝氨酸富集12 | - | HPRD | 14559993 |
| SNRNP40 | 40k |FLJ41108 |HPRP8BP |MGC1910 |prp8bp |prpf8bp |RP11-490K7.3 |SPF38 |WDR57 | 小核核糖核蛋白40KDA（U5） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| SNRPB | 鳕鱼|SNRPB1 |SMB/SMB'|snrnp-b | 小核核糖核蛋白多肽B和B1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg剪接体 | 128 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 | 140 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA处理 | 161 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA剪接 | 111 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA剪接次要途径 | 45 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 | 110 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Menssen MYC目标 | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TACI DN的moreaux b淋巴细胞成熟 | 73 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莫迪海马产前 | 42 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 营地结肠癌复制号码 | 92 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Myc Up监管 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应14 | 143 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta EBNA1反相关 | 173 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村脂肪形成晚期 | 104 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 艾布拉姆森与艾尔互动 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |