基因页:NDST3
概括?
基因 | 9348 |
象征 | NDST3 |
同义词 | HSST3 |
描述 | N-二乙酰基酶/N-硫代转移酶3 |
参考 | MIM:603950|HGNC:HGNC:7682|ENSEMBL:ENSG00000164100|Vega:Otthumg00000132959 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q26 |
Pascal P值 | 3.839E-4 |
Sherlock P值 | 0.785 |
胎儿β | -0.434 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17029291 | CHR3 | 32402138 | NDST3 | 9348 | 8.465e-6 | 反式 | ||
RS830202 | CHR3 | 165654796 | NDST3 | 9348 | 0.19 | 反式 | ||
RS7894597 | Chr10 | 9384581 | NDST3 | 9348 | 0.13 | 反式 | ||
RS1324669 | CHR13 | 107872446 | NDST3 | 9348 | 0.07 | 反式 | ||
RS17145698 | Chrx | 40218345 | NDST3 | 9348 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NDST3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LPAR6 | 0.74 | 0.68 |
Ly96 | 0.74 | 0.60 |
AL050337.1 | 0.71 | 0.52 |
AL138743.2 | 0.70 | 0.57 |
CGRRF1 | 0.70 | 0.68 |
Spdya | 0.69 | 0.34 |
ACOT13 | 0.69 | 0.70 |
IMMP1L | 0.68 | 0.69 |
mtcp1nb | 0.68 | 0.66 |
SCRG1 | 0.68 | 0.59 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tnks1bp1 | -0.54 | -0.55 |
myo18a | -0.52 | -0.48 |
FAM129B | -0.52 | -0.61 |
clip2 | -0.52 | -0.53 |
CADM4 | -0.51 | -0.52 |
SMG6 | -0.51 | -0.49 |
PHACTR3 | -0.50 | -0.48 |
DHX37 | -0.50 | -0.51 |
WDR81 | -0.50 | -0.47 |
SUPT6H | -0.50 | -0.47 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008146 | 硫代转移酶活性 | IEA | - | |
去:0015016 | [硫酸乙酰肝素] - 葡萄糖胺N-硫代转移酶活性 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG糖胺聚糖生物合成乙par硫酸盐 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HS GAG生物合成 | 31 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome硫酸乙酰肝素肝素HS GAG代谢 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖胺聚糖代谢 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |