基因页:RPL23
概括?
基因 | 9349 |
象征 | RPL23 |
同义词 | L23 | RPL17 |
描述 | 核糖体蛋白L23 |
参考 | MIM:603662|HGNC:HGNC:10316|HPRD:04716| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q |
Pascal P值 | 2.567E-4 |
Sherlock P值 | 0.702 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0064 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RPL23_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DHX30 | 0.94 | 0.93 |
CTBP1 | 0.93 | 0.92 |
HGS | 0.93 | 0.92 |
MBD1 | 0.93 | 0.91 |
pank4 | 0.92 | 0.90 |
clptm1l | 0.91 | 0.91 |
AP1M1 | 0.91 | 0.91 |
maea | 0.91 | 0.90 |
ranbp3 | 0.91 | 0.91 |
IGHMBP2 | 0.91 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.80 | -0.79 |
MT-CO2 | -0.79 | -0.78 |
AF347015.21 | -0.78 | -0.82 |
AF347015.8 | -0.76 | -0.78 |
AF347015.27 | -0.75 | -0.78 |
mt-cyb | -0.75 | -0.75 |
AF347015.33 | -0.75 | -0.73 |
AF347015.2 | -0.73 | -0.74 |
AF347015.15 | -0.72 | -0.74 |
鼻孔 | -0.71 | -0.70 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003735 | 核糖体的结构成分 | IEA | - | |
去:0003735 | 核糖体的结构成分 | nas | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006414 | 翻译伸长 | 经验 | 15189156 | |
去:0006412 | 翻译 | IEA | - | |
去:0006610 | 核糖体蛋白进口到核中 | nas | 1874450 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 14567916 | |
去:0005840 | 核糖体 | IEA | - | |
去:0005840 | 核糖体 | nas | 1874450 | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg核糖体 | 88 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53调节途径 | 59 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SRP依赖性共通晶蛋白靶向膜 | 179 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽链伸长 | 153 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 | 176 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感病毒RNA转录和复制 | 169 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 | 176 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌2小时 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌6小时 | 55 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Midorikawa在肝癌中扩增 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PTCH1和Sufu的Lee目标 | 53 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞发育DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 | 174 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D | 139 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mellman Tut1靶向 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Keshelava多种耐药性 | 88 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙血清和雷帕霉素敏感基因 | 68 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |